В 1248 г., по благословению папы римского, Людовик IX во главе крестоносцев прибыл на Кипр, а весной 1249 г. – в Египет, где захватил Дамиетту.
В 1250 г. Людовик IX достиг Мансуры, но к тому времени среди крестоносцев начались внутренние раздоры, поэтому рыцарям Креста пришлось отступать к Дамиетте. В ходе отступления сарацины захватили Людовика IX в плен. В обмен на свою свободу король отдал им Дамиетту.
В мае 1250 г. Людовик покинул Египет и в течение 4 лет, с 1250 по 1254 г., находился в Сирии, ожидая подкрепления. Находясь в Сирии, Людовик налаживал дипломатические отношения с азиатскими правителями, предпринимал меры по укреплению Яффы, Кесари и Сидона, поддерживал христиан в Палестине.
Получив известие о смерти матери, Людовик поспешил вернуться во Францию, чтобы вплотную заняться государственными делами.
Людовик IX Святой пользовался огромным уважением не только у своих подданных. Даже иноземцы нередко обращались к нему с просьбой рассудить их споры.
Людовик IX уважительно относился к правам своих вассалов, но в то же время предпринимал меры по укреплению и усилению королевской власти. Он провел ряд судебных реформ, в частности, сделал королевский суд всеобщим верховным судом, решения которого были обязательны для всех вассалов. Были запрещены частные войны и судебные поединки, когда спор решался единоборством сторон и правда признавалась за победителем. Людовик IX ввел право апелляции: теперь недовольные решением местных судов могли подать жалобу в королевский суд. Людовик XI значительно расширил судебные полномочия короля. Центральным судебным учреждением стал парижский парламент. При Людовике был составлен и издан свод законов.
В отношениях с Римом Людовик IX всегда твердо и смело отстаивал интересы Франции. Французское духовенство склонно было поддерживать своего короля, а не Римского папу. В 1269 г. была издана «Прагматическая санкция», которая декларировала независимость французской Церкви от Рима и отменяла денежные взносы в пользу папского двора.
В 1270 г. Людовик IX отправился в очередной, Восьмой, крестовый поход. Войско остановилось в Тунисе, ожидая прибытия Карла Анжуйского. Вскоре среди рыцарей вспыхнула эпидемия. Болезнь не пощадила и короля. 25 августа 1270 г. Людовик IX скончался.