На основных факультетах были изменены учебные программы. В тематический план по основам марксизма-ленинизма включались новые темы, раскрывающие содержание и основные направления военной политики нашей партии. В ходе учебного процесса слушатели изучали ленинское военно-теоретическое наследие, особенно учение о защите социалистического Отечества.

Кафедра международных отношений и внешней политики СССР освещала вопросы внешнеполитической деятельности партии, борьбы Советского Союза на международной арене против гитлеровских агрессоров, за укрепление антифашистской коалиции.

Преподавание курса партийно-политической работы в Красной Армии строилось на основе «Программы для подготовки комиссаров и политработников», утвержденной начальником Главного политического управления РККА в августе 1941 г. Слушатели изучали следующие темы: политорганы и партийно-политический аппарат, агитационно-пропагандистская и воспитательная работа в Красной Армии, партийно-политическая работа по обеспечению боевых действий Красной Армии, политическая работа по разложению войск противника, идеологическая обработка солдат в фашистской армии[318].

Особое внимание уделялось обобщению и глубокому усвоению форм и методов партийно-политической работы в боевых условиях на фронтах Великой Отечественной войны. В этих целях широко использовалась военная печать, обобщенные материалы Главного политического управления РККА, политических управлений фронтов, совещания по обмену опытом работы политработников на фронте.

Так, 6 августа 1941 г. в академии состоялось совещание профессорско-преподавательского состава по обобщению опыта партийно-политической работы в боевых условиях первых месяцев войны. На этом совещании выступили преподаватели, которые ранее специально были командированы на фронт. 5 октября 1941 г. на собрании слушателей – выпускников и начальствующего состава академии выступил участник первых боев с немецко-фашистскими захватчиками старший политрук 24-й дважды Краснознаменной Самаро-Ульяновской дивизии Поляков.

По-новому организовывалась работа кафедр военных дисциплин. На изучение военных дисциплин отводилось до 65 % всего учебного времени. Было увеличено количество часов на преподавание тактики танковых войск, огневой подготовки.

16 октября 1941 г. Военно-политическая академия получила приказ об эвакуации из Москвы в город Белебей Башкирской АССР. Новый учебный год начался в ноябре 1941 г. Начальником академии был назначен бригадный комиссар А.Н. Щербаков, его заместителем – полковник И.И. Зубков, начальником политотдела – полковой комиссар С.С. Шатилов. Преодолев большие трудности, преподаватели и слушатели сравнительно быстро сумели наладить учебный процесс и научную жизнь академии на новом месте. Особое внимание было обращено на устранение выявленных недостатков в преподавании, особенно военных дисциплин, на всестороннее обобщение и изучение опыта боевых действий на фронтах Великой Отечественной войны.