— Одновременно с судебной реформой его правительство начало осуществлять коренную реформу управления, в том числе и местного, основу которого составляла власть присылаемых из центра представителей-наместников. С населения эти наместники собирали пошлины в свой карман и таким образом буквально кормились за его счет, нередко действуя в управляемых областях едва ли не как удельные князья, безнаказанно грабя народ. Для того чтобы пресечь подобное в будущем, Ивана IV во-первых, со своей стороны стал более жестко контролировать деятельность наместников, создав для этого специальные приказы. Во-вторых, Судебник 1550 г., еще сохраняя сам институт «кормлений», впервые четко поставил власть столь ненавистных народу «кормленщиков-наместников» и под контроль «снизу» со стороны народа. «Кормленщиков-наместников» на местах теперь контролировали выборные земские старосты и целовальники. Их участие в местных судебных разбирательствах отныне было обязательным, а это «открывало возможность борьбы против произвола наместничьего суда прежде всего черному, посадскому и деревенскому населению» писал историк Ключевский. В перспективе же правительство Грозного явно стремилось к тому, чтобы постепенно полностью ликвидировать власть наместников, заменив их, как писал Ключевский, в «коронных областных управителей» «земским самоуправлением». Факт этот подтверждается например тем, что уже в 1555–1556 гг. в Устюге Великом и прилегающих к нему волостях специальной царской грамотой должность кормленщика была упразднена. Из-за поборов наместника, говорилось в грамоте, царю «от крестьян челобитья великие», а потому «мы (царь) жалуючи крестьянство… наместников и волостелей… от городов и волостей отставили». Неправда ли странное поведение для «кровавого тирана» и самодура!?

— Разумеется, это нововведение царя явилось жестоким ударом для родовитых княжат и столбовых бояр, в руках которых от века находились должности наместников. Теперь их своевольству был положен предел, а за взяточничество и волокиту любого из них просто могли привлечь к суду! Дело для средневековой Европы вовсе не слыханное! Естественно противодействие столбового боярства было неминуемо, доходя до мятежей бояр против царя.

— В те же 1549-1550-е годы Иван нанес боярству и еще один страшный удар. Государем был издан указ об отмене местничества — системы чрезвычайно тормозившей развитие государства. Решительно отвергнув прежний порядок распределения государственных должностей между претендентами в строгом соответствии со знатностью их фамилий. Ивана IV запретил местничество прежде всего в армии, потребовав от своей аристократии служить «без мест». Таким образом, монополия княжеско-боярской знати на занятие высоких постов в армии, исходя из местнических родословных счетов, ломалась и правительство получало возможность назначать воеводами того кого оно считало нужным! В зависимости от военного таланта и деловых качеств, что несомненно повлияло на качество командного состава русской армии.