Досьё на него, его людей в министерстве и армии начали собирать ещё в 1899 году, но, окончательно он стал "нашим" после исчезновение С.Ю.Витте, и "потери" сына на трое суток осенью того же 1902 года.
Вот такими гнусными и неправедными способами мы были вынуждены заставлять честно, согласно данной присяги служить Отечеству, военного министра Империи!!! Это одна из самых позорных страниц в истории русской армии!
Материалы досье Куропаткиным были прочитаны, сын нашелся, и после этого военный министр начал исправляться, стал, тем, кем и должен был быть по долгу службы, защитником Отечества! Вернулся к своей профессии, о которой мне написал мой знакомый в Судане, — "Есть такая профессия, Родину защищать!"
Через "обновленного" министра начали готовить армию к войне с Японией в режиме крайнего форс-мажора, благо тоже "обновлённые" министры финансов Эдуард Дмитриевич Плеске и сменивший его Влади́мир Никола́евич Коко́вцов, не особо были против его предложений по улучшению положения в армии, и особенно касаемо Дальнего Востока. Пасхальные события 1903 года, ещё больше упростили и ускорили подготовку к войне, ведь благодаря им были убраны многие препятствия для этого.
В первую очередь взялись на увеличение пропускной способности Транссибирской магистрали, кому как не участнику походов в Среднюю Азию знать о важности путей сообщения для снабжения и увеличения сил и средств армии, на удаленных театрах военных действий, каким и должна была стать война с Японией. В июне 1903 года император отдал категоричный приказ министру путей сообщений князю Михаилу Ивановичу Хилкову и Минфину, начать решать этот вопрос незамедлительно, армия к этому подключала свои инженерные войска и железнодорожные части.
Не без давления из вне Куропаткин к удивлению многих сам поднял вопрос об усилении роли Генерального штаба в жизни армии, но в составе Военного министерства, ссылаясь на опыт Германии, а так же оставшийся в тени этого, предложение о передачи береговой обороны флоту, на, что флот в лице генерал-адмирала великого князя Александра Михайловича, уже без приставки в.и. о отреагировал быстро и положительно. Начали разрабатываться на основе новейшего опыты последних войн новые уставы, в армию пошли пулемёты, сделали заказы на них в Германии и Дании, вновь подняли вопрос об использовании имеющихся тяжелых орудий в качестве полевых, было отдано распоряжение решить этот вопрос уже на практике в ближайшее время, были сделаны заказы на изготовление полевых кухонь, пакетов первой медицинской помощи, тем более, что имелись уже готовые образцы и в России уже выполняли подобные заказы. На Дальнем Востоке начали делать съёмку местности, пошёл в гору процесс строительства укреплений во Владивостоке, арсеналы и заводы получили заказы переделку 107 мм батарейных орудий в гаубицы, картечницы в станковые пулемёты, от пушечных заводов потребовали увеличить производство новых 76 мм полевых орудий, от патронных увеличить производство своей продукции, начали перезаряжать снаряды полевой артиллерии мелинитом и пироксилином. Принялись создавать запасы боеприпасов, снаряжения, продовольствия и прочих запасов на Дальнем Востоке, планировали создать цеха по производству и перезарядки патронов в Иркутске и Владивостоке, и многое другое, из того, что нужно уже было сделать, как говориться ещё вчера. Вольно невольно военный министр был вынужден разгонять своё министерство, чтоб успеть хоть немного подготовить армию к надвигающейся войне. Так в ноябре 1902 года военный агент полковник Б.П. Ванновский был отозван из Японии, поскольку с момента своего назначения в 1898 году, оказался бесплодным в плане выполнения своей миссии как явной так и не явной. На его место был назначен полковник Евге́ний-Лю́двиг Ка́рлович Ми́ллер, до этого бывший на той же должности в Бельгии и Италии, который должен был успеть сделать хоть что-то.