К тому же, как было на практике рассмотрения дел оперативного учета, окончательное решение по важным шпионским делам, а дело оперативной разработки (ДОР) на «Дипломата» являлось, без сомнения таковым, принимал сам председатель КГБ СССР. Ему представлялась докладная записка с предложениями по делу и визами как начальника управления КГБ, в производстве которого находилось также дело, так и куратора из числа заместителей председателя КГБ, а также других лиц, имевших отношение к проверке или разработке.
Затем вялотекущая проверка продолжалась до октября 1985 г., то есть до того момента, когда резидентурой ПГУ КГБ в Вашингтоне от начальника отдела ЦРУ О. Эймса, пошедшего на контакт с КГБ в апреле 1985 г., были получены данные на ряд сотрудников КГБ и ГРУ, работавших на американцев. И среди названных изменников Родины Эймс указал и на Полякова. Теперь фантастической удаче и необыкновенно длительней карьере этого американского шпиона подходил конец.
После ряда проведенных сотрудниками 3-го Главного управления КГБ оперативно-технических и агентурных мероприятий, дело оперативной проверки на «Дипломата» переводится в ДОР с окраской «измена Родине в форме шпионажа». Все получаемые оперативной группой на «Дипломата» материалы оперативно докладывались председателю КГБ СССР В. М. Чебрикову. С января 1986 г. с его санкции сотрудниками 3-го Главного управления совместно со Следственным отделом КГБ исследуется возможность реализации ДОР путем возбуждения уголовного дела и проведения оперативно-следственных действий, направленных на разоблачение Полякова.
6 июля 1986 г. Полякову исполнилось 65 лет. Свой юбилей он отмечал дома, в квартире на улице Калинина в доме 37/12, доставшейся его жене от ее родителей. Собралось довольно много родственников и бывших сослуживцев, выступавших с приятными для его слуха речами, отмечавшими его заслуги перед Родиной, партией и родным разведывательным сообществом. Было много телефонных звонков с поздравлениями. Позвонил ему и его бывший заместитель по факультету Военно-дипломатической академии, который тепло поздравил с юбилейной датой и пригласил его на следующий день посетить академию. По его словам, они собирают ветеранов, имеющих склонность к научно-исследовательской работе, чтобы использовать их опыт и знания в написании учебных пособий для слушателей академик. Поляков согласился прибыть в бюро пропусков академии к 10 часам 30 мин. Впоследствии, уже на судебном заседании Военной коллегии Верховного суда СССР, 24 ноября 1987 г. он скажет, что, когда его бывший заместитель вызвал его в академию, он уже знал, что идет на арест.