Одновременно в тылу врага создавались партизанские отряды. По призыву партии трудовой Урал встал на борьбу с неприятелем. Наибольшую опасность здесь представляла челябинская группировка белочехов. Заняв 26 мая город, интервенты двинулись к Троицку, на соединение с белоказаками. Председатель Троицкого Совета Я. В. Аппельбаум запросил помощи. В телеграмме Н. И. Подвойскому он писал: «В Троицке создалось крайне тяжелое положение… Здесь крайне необходим Блюхер, хорошо знакомый с местностью и уже руководивший подавлением казачьего мятежа. Содействуйте приезду из Оренбурга в Троицк Блюхера».

В неравной борьбе Троицк пал. Все отступившие к Верхнеуральску части решено было объединить в Троицкий отряд. Командиром его избрали казака Николая Дмитриевича Томина.

В Верхнеуральске партийный комитет формировал свой отряд под командованием Ивана Дмитриевича Каширина. 7 июля партизаны оставили город и направились в расположенный в горах Белорецк. Вскоре сюда прибыли из-под Оренбурга отряды В. К. Блюхера и Н. Д. Каширина. 16 июля состоялось совещание командного состава отрядов для создания единого штаба и выработки плана совместных действий. Было предложено два плана: один — Николая Дмитриевича Каширина — прорываться через Верхнеуральск — Миас к Екатеринбургу, другой — В. К. Блюхера — идти через горнозаводские районы на север. «Двигаясь по рабочим районам, — говорил он, — мы значительно усилим свои ряды за счет рабочих заводов, двигаясь же на Верхнеуральск, через районы, охваченные восстанием белоказаков, мы не достигнем своей цели». Однако большинство командиров высказались за план Н. Д. Каширина, который на этом совещании был избран партизанским главкомом. Через два дня партизаны тронулись в путь. У горы Извоз они разбили белоказаков и отбросили их за Верхнеуральск. Но дальнейшее наступление в этом направлении из-за недостатка сил пришлось приостановить и вернуться в Белорецк.

2 августа состоялось очередное совещание, которое должно было наметить новый план похода и избрать главкома, — Н. Д. Каширин был тяжело ранен под Верхнеуральском. Обсудив создавшуюся обстановку, руководители партизан единогласно приняли предложенный ранее план Блюхера и избрали его главкомом.

Первым делом он занялся реорганизацией партизанских отрядов и подготовкой их к длительному и опасному походу по тылам врага. В результате была создана стройная система управления[3].

Одновременно по указанию главкома коммунисты развернули агитационную работу в отрядах. Тем, кто не верил в победу, кто сомневался в ней, предлагали вернуться домой.