Паин Э. Татарстанский договор на фоне чеченского кризиса // Год планеты: Политика. Экономика. Бизнес. Культура / ИМЭМО РАН. М.: Республика, 1995. С. 163–168.

Паин Э. Управление культурным разнообразием в городах: новая парадигма в регулировании этнополитических отношений в России // Государственная служба. 2016. Ноябрь — декабрь. № 106. С. 66–73.

Паин Э. Центральная Азия: модели национальной политики новых независимых государств // Российский монитор. 1995. № 5. С. 20–33.

Паин Э. Чеченский и другие конфликты в России // Международная жизнь. 1998. № 9. С. 90–92.

Паин Э., Попов А. Принятие политических решений в вопросах использования силы в США и России. Силовая политика России // Как делается политика в США и России / Под ред. Дж. Азраэла и др. М.: Комплекс-Прогресс, 1996. С. 281–301.

Паин Э. А. «Социальная эстафета» и другие механизмы воспроизводства стереотипов социального поведения // X Сократические чтения: Реальность как социальные эстафеты. М.: Эслан, 2015. С. 74–88. URL: https://publications.hse.ru/view/202245498.

Паин Э. А. Имперский национализм: возникновение, эволюция и политические перспективы в России // Общественные науки и современность. 2015. № 2. С. 54–71.

Паин Э. А. Межэтнические отношения: терминология, история, современные теории и место в системе государственного управления // Управление межэтническими и конфессиональными отношениями: теория и практика: Уч. пособие. М.: Проспект, 2020.

Паин Э. А. Не гуманизмом единым. Вынужденные национально-территориальные реформы в период оттепели 1950‐х годов // МБХ медиа. 2020. 20.05. URL: https://mbk-news.appspot.com/sences/ne-gumanizmom/.

Паин Э. А. Палач-благодетель: мифы и парадоксы десталинизации в национальной политике 1950‐х годов // МБХ медиа. 2020. 13.05. URL: https://mbk-news.appspot.com/sences/palach-blagodetel-mify/.