Императором Франкской Романии был избран Балдуин, граф Фландрский — один из предводителей крестоносцев. Ему как вассалы были подчинены король Фессалоникийский — Бонифаций Монферратский, другой предводитель крестоносцев — герцог Афинский и герцог Ахейский. Поскольку император был выбран из крестоносцев, то из венецианцев избрали нового патриарха Константинопольского — Томазо Морозини. В начале своего существования империя была вынуждена вести войну с бывшими византийскими императорами — Алексеем III, Алексеем V и Львом Стругом, вождем освободительного движения на Пелопоннесе. В Эпире укрепился как самостоятельный государь Михаил Ангел Комнен, в Малой Азии из обломков Византии образовались две небольшие империи — Трапезундская и Никейская.
К врагам молодой Латинской империи присоединился и болгарский царь Калоян. (Балдуин I умер в болгарском плену.) Брату и наследнику Балдуина Генриху удалось временно сконсолидировать империю, преодолев феодальные распри и оттеснив внешних врагов.
Между завоевателями и местными землевладельцами существовали сильнейшие противоречия. Феодалы-завоеватели старались присвоить огромные владения греческой церкви, что вызывало отчаянное сопротивление духовенства.
Никейский император Михаил Палеолог победил эпиротов и их латинских союзников при Палегонии В 1259 году. В 1261-м он занял Константинополь. Франкская Романия как империя прекратила свое существование, однако в герцогстве Афинах латинская власть существовала до 1458 года, до завоевания турками, а в Пелопоннесе — до 1429-го.