Ослабление греческого флота сразу привело к возвращению турецких кораблей, причем они подоспели как раз вовремя, чтобы перехватить лорда Байрона, который 30 декабря отправился с Занте. Его корабль вошел в гавань Драгоместре, что примерно в 20 милях к северо-западу от Месолонгиона, и оттуда он добрался до места назначения 5 января. Остальные суда, которые следовали вместе с кораблем лорда Байрона, были захвачены и отведены в Патры, однако вскоре освобождены. Немного позже – 18 января – корабли со Специи тоже ушли домой, оставив турок на несколько месяцев хозяевами положения. Правда, те почти ничего не делали ни на суше, ни на море. В феврале они потеряли два брига – один потерпел крушение, другой взорвался – и в мае ушли в Александрию на соединение с египетским флотом.

Султан наконец был вынужден обратиться к паше Египта Мухаммеду Али, предложив использовать его более современные силы для достижения того, чего не могли добиться ни турецкая армия, ни турецкий флот, – подавления греческой революции. Он уже предназначил Крит для египетского паши, и покорение острова было почти завершено. Теперь он поручил ему вернуть Морею.

Для этого было необходимо доставить из Египта в Грецию большую армию, что, в свою очередь, требовало сбора многочисленных транспортов и объединения турецкого и египетского военно-морского флота для прикрытия их морского перехода. Тем временем оба флота вели операции, направленные на уменьшение возможностей греков для вмешательства. Они атаковали две главные базы греческого флота – остров Псара и маленький островок Каксос, расположенный в 30 милях к востоку от Крита.

Каксос пострадал первым. Обстрел 2 июня силами 17 египетских военных кораблей не был продолжен, но 18-го прибыли более крупные силы из 45 кораблей, и после двухдневного обстрела высадка войск привела к успеху. Около 18 вооруженных судов и 40 мелких плавсредств были захвачены или уничтожены, защитники острова были убиты, женщины и дети уведены в рабство. Как это часто случается, помощь опоздала. Несколько кораблей с Гидры находились в критских водах в апреле, но ушли после прибытия многократно превосходящих египетских сил. Поэтому о нападении на Каксос ничего не было известно, пока все не закончилось. Вице-адмирал Сахтурис вышел в море с 13 кораблями со Специи и 14 – с Гидры 29 июня. Флот подошел к Каксосу 3 июля. К этому времени египетский флот уже вернулся в Александрию. А уже 7-го Сахтурис был срочно отозван из-за нападения турок на Псару, которое на самом деле началось в тот самый день, когда его флот подошел к Каксосу.