Вскоре, однако, Бадр и и шейх племен кавасим вновь сильно повздорили. Спровоцировал раздор правитель острова Кешм, и Бадр отправил туда экспедицию. Шейха Хуссайна захватили, доставили в Маскат и удерживали в качестве заложника. Отпустили в начале 1807 г., получив в качестве выкупа согласие вернуть Маскату острова Кешм и Ормуз.

В конце 1806 г., желая полностью отодвинуть своих кузенов, Салима и Са’ида, от управления делами в Маскате, Бадр ибн Сайф отдал Салиму в управление Масна’а, а Са’иду – Барку. Если Салим назначение свое губернатором Масна’а воспринял спокойно, то Са’ид счел себя не только обиженным, но и оскорбленным. Подстрекаемый своими сторонниками, Са’ид решил вернуть себе Маскат, а заодно избавить и себя, и страну от Бадра, и стоявших за его спиной ваххабитов. Замыслил организовать убийство Бадра. Обратился за помощью к шейху Мухаммаду ибн Насиру ал-Джабри. Лично участвовать в устранении Бадра он не захотел, но от оказания помощи в организации заговора не отказался.

Под каким-то благовидным предлогом сеййид Са’ид заманил Бадра на встречу в деревушку На’аман, что в 4 милях от Барки. В беседе, состоявшейся там, принимал участие, кроме них двоих, еще шейх Мухаммад ибн Насир, которого сопровождал преданный ему слуга, подававший им кофе. Шейх Мухаммад смог ловко обезоружить Бадра, выхватив из его ножен кинжал. Как только он это сделал, сеййид Са’ид тотчас же набросился на Бадра, и ударом меча отсек ему руку. Несмотря на страшную боль, Бадр защищался отважно. И даже смог вырваться из дома, выпрыгнув из окна. Вскочил на лошадь, и пытался, было, бежать. Гвардейцы-телохранители сеййида Са’ида, заранее проинструктированные своим господином, бросились за ним вдогонку. Бадр, потерявший много крови и обессиливший, свалился с лошади. Гвардейцы его настигли и мечами буквально рассекли на части. Произошло это в марте 1807 года. Период регенства Бадра был недолгим.

Ваххабитский гарнизон, располагавшийся в Барке, монимая, что недовольство им местного населения в свете случившегося может вырваться наружу, место своего расквартирования сразу же покинул и возвратился в Эль-Бурайми.

Опасаясь гнева ваххабитов из-за убийства их союзника, Бадра ибн Сайфа, сеййид Са’ид незамедлительно написал письмо эмиру Са’уду, и, ничтоже сумняшеся, обвинил в убийсте Бадра шейха Мухаммада ибн Насира. Назвал его мятежником, и даже призвал ваххабитов к совместным с ним действиям против него. Письмо это, препровожденное богатыми подарками, отправил в Эль-Дир’иййю со специальным посланником.