Верный ученик преподобного Варнавы Гефсиманского сперва собирался поступить в Свято-Троицкую Сергиеву Лавру, чтобы подвизаться у мощей своего духоносного наставника в Гефсиманском скиту. Однако Господь судил иначе. Василий Николаевич неожиданно получил благословение митрополита Петроградского и Гдовского Вениамина на принятие монашеского пострига в Александро-Невской лавре. 29 октября 1920 года наместник лавры архимандрит Николай (Ярушевич) постриг послушника Василия Муравьева в монашество с наречением ему имени Варнава в честь духовного отца, старца Варнавы Гефсиманского.

В 1926 году архимандрит Сергий (Бирюков) стал готовить отца Варнаву к принятию послушания духовника. Перед тем как начать свое старческое служение, отец Варнава выразил желание облечься в великую схиму. При постриге в великую схиму он был наречен именем Серафим в честь преподобного Серафима Саровского, чудотворца.

На поприще духовника Александро-Невской Лавры иеросхимонах Серафим (Муравьев) пребывал почти три года. Во время ежедневных многочасовых исповедей батюшке приходилось подолгу стоять на холодном каменном полу Свято-Троицкого собора. Здоровье отца Серафима резко ухудшилось. Медики настоятельно советовали выехать из города в зеленую зону. В качестве климатического курорта была рекомендована Вырица. К лету 1930 года отец Серафим покинул город святого апостола Петра. После переезда в Вырицу к врачам он уже не обращался, говоря: «Буди на все воля Божия. Болезнь – это школа смирения, где воистину познаешь немощь свою…»

Подвиги поста, бдения и молитвы, которые в течение двух десятилетий смиренно нес вырицкий старец, можно сравнить лишь с подвигами древних аскетов-отшельников. В понедельник, среду и пятницу старец вообще не принимал никакой пищи, а иногда ничего не вкушал и по нескольку дней подряд. То, что он ел в те дни, когда принимал пищу, едой можно было назвать с большим трудом. Об отце Серафиме можно было сказать: «Он питается Святым Духом». Благодать Божия несомненно подкрепляла великого постника. Священники вырицкой Казанской церкви еженедельно причащали батюшку Святых Христовых Таин.

Подражая своему небесному учителю, вырицкий старец принял на себя новый подвиг. Он молился в саду на камне перед иконой саровского чудотворца. Это бывало в те дни, когда несколько улучшалось здоровье старца. Первые свидетельства о молении святого Серафима Вырицкого на камне относятся к 1935 году, когда гонители обрушили на Церковь новые страшные удары. С началом Великой Отечественной войны старец усилил подвиг моления на камне – стал совершать его ежедневно. И достигали Престола Божия молитвы незабвенного старца. Известно, что в самой Вырице, как и было предсказано старцем, не пострадал ни один жилой дом, и не погиб ни один человек.