В октябре 1917 г. с падением власти Временного правительства В.А. Харламов вернулся на родину в Новочеркасск и избран председателем Правительства Юго-Восточного Союза, в который входили Донские, Кубанские, Терские, Астраханские и Уральские войска, горцы Северного Кавказа, Черноморской и Ставропольской губерний. В канун 1918 г. Союз прекратил свое существование вследствие перехода власти к большевикам. После самоликвидации Донской советской республики в августе 1918 г. Харламов был избран председателем Донского Войскового Круга и руководил его работой вплоть до эвакуации из Новороссийска в марте 1920 г. Под его председательством Большой Войсковой круг принял выработанные донским атаманом, генералом Красновым основные законы – конституцию Всевеликого Войска Донского, которая провозглашала политическую независимость Дона. В 1919 г. Харламов – председатель конференции представителей казачьих государственных образований Дона, Кубани, Терека и правительства главного командования Юга России генерала Деникина. В марте 1920 г. Харламов вместе с женой, сыном, дочерью, а также с Донским атаманом, Войсковым Правительством и Войсковым Кругом ушел в эмиграцию через Новороссийск, Крым в Константинополь. Из Константинополя в июне 1920 г. семья переехала в Париж, где прожила два года, затем выехала в Софию, оттуда – в Белград. Василий Акимович стал одним из виднейших политических и общественных деятелей в эмиграции. Он посетил Париж, Лондон, Белград, Софию. Везде налаживал связи с правительствами этих стран. Вместе с атаманом Богаевским хлопотал о расселении и об устройстве казаков на работу в этих странах. Под председательством В.А. Харламова начала активно работать Историческая комиссия и издаваться книги, повествующие об истории Донского края: «Донская летопись» в 3 томах, «Казаки за границей», «Казаки в Гатадже и на Ленмносе», а также труд профессора Сватикова «Россия и Дон». В октябре 1923 г. семья Харламовых приехала в Прагу, где прожила долгие годы. Здесь Василий Акимович принимал активное участие в создании Русского Народного университета и двух русских гимназий, а также был многолетним издателем и редактором журнала «Казачий путь» и председателем Общеказачьего Сельскохозяйственного союза. По ходатайству Союза в Прагу переехало много сотен казачьей молодежи и студентов для получения образования в различных школах и высших учебных заведениях Чехословакии. Находясь в Праге, Харламов от имени Донской исторической комиссии, председателем которой он был, возбудил ходатайство перед Министерством Иностранных дел о перемещении из Белграда в Прагу реликвий, вывезенных Донским правительством из Новочеркасского музея и Донского архива. В 1925 г. реликвии прибыли в Прагу. В 1945 г. Василий Акимович покинул с семьей Прагу и в течение трех лет жил в Регенсбурге в Баварии, откуда в 1948 г. эмигрировал в Аргентину в Буэнос-Айрес. В 1957 г. на 83-м году жизни В.А. Харламов умер от травм, полученных в дорожно-транспортном происшествии, и похоронен на Английском кладбище в Буэнос-Айресе[596].