Поселения 2-й ступени (Кукутени А₃) среднего периода известны в большем количестве, однако из них достаточно полно раскопаны лишь Березовское (Цыбесков В.П., 1964, 1967; 1971; 1975; 1976) и Сабатиновка I (АДТБ, 1933; Пассек Т.С., 1949а; Добровольський А.В., 1952) в Побужье, Поливанов Яр III (Пассек Т.С., 1961а; Попова Т.А., 1972; 1980а; 1980б) и Новые Русешты I_1a (Маркевич В.И., 1970а) в Поднестровье, Кукутени-Четэцуя I (Schmidt H., 1932) и Хэбэшешти I (Dumitrescu V., Dumitrescu H., Petrescu-Dîmboviţa M., Gostar N., 1954) в Молдавском Прикарпатье (карта 5; табл. 9). В Буго-Днестровском междуречье небольшие раскопки проводились на поселениях борисовского типа (карта 4, III, 5). Исследовались поселения Борисовка (Бiляшiвський М., 1926; Пассек Т.С., 1961а), Озаринцы (Рудинський М.Я., 1930), Красноставка (Белановская Т.Д., 1957), Печоры (Черныш Е.К., 1959а) и Зарубинцы (Цвек Е.В., 1980б). Поселения обнаружены вблизи рек в различных топографических условиях: на естественно укрепленных мысах (Поливанов Яр III, Кукутени-Четэцуя I), на холмах (Хэбэшешти I), по берегам рек (Березовское, Сабатиновка I), в высокой пойме (Новые Русешты I_1a). Площадь их невелика — от 1,2 (Березовское) до 2,5 га (Поливанов Яр III).

Некоторые поселения с напольной стороны были укреплены оборонительными рвом и валом. Валы редко сохраняются даже в оплывшем состоянии. Рвы, как правило, имеют клиновидный профиль. Ширина их у дна составляет не более 0,3–0,5 м. Поселение Поливанов Яр III укреплялось дважды. Первый ров протяженностью около 75 м при ширине (в верхней части) и глубине 2 м был засыпан, когда возникла необходимость расширить площадь поселения, а на расстоянии 16 м от него выкопан новый ров. Близкие размеры имел ров и на поселении Кукутени-Четэцуя I. Длина его достигала около 100 м, ширина в верхней части 2,5 м, глубина 2 м. Поселение Хэбэшешти I, возможно, изначально было ограждено двумя рвами, располагавшимися в 20 м друг от друга. Их протяженность составляла примерно 120 м, ширина 3,5–7,0 м. Внутренний ров имел глубину 1,50-2,75 м, внешний — 2,25-3,55 м. По размерам эти рвы значительно крупнее докукутенских, глубина которых варьирует в пределах 1,4–1,9 м (Marinescu-Bîlcu S., 1974с).

Хэбэшешти I — единственное вскрытое полностью поселение 2-й ступени среднего периода (Dumitrescu V., Dumitrescu H., Petrescu-Dîmboviţa M., Gostar N., 1954). Исследователям удалось создать его графическую реконструкцию (табл. LXIX, 2). Оно было устроено на мысу площадью в 1,5 га и состояло из 44 наземных жилых домов, нескольких хозяйственных построек и множества ям. На склоне мыса находились гончарные печи, от которых сохранились лишь обломки глиняных решеток. Поселение планировалось с учетом будущего строительства. Первоначально жилища для новых семей сооружались рядом с родительским домом, позднее — на свободной территории близ оборонительных рвов. Основавшая поселение община застроила сначала два участка: один в средней, другой — в восточной части мыса. На каждом из этих участков жилища средних размеров (40–80 кв. м) располагались по кругу, в центре которого на небольшой площади стоял большой (136 и 150 кв. м) дом. Застроенный позднее участок в западной части мыса, поблизости от оборонительных рвов, четкой планировки не имел. Там, как и на остальной площади поселения, наблюдалась концентрация жилищ в обособленные группы, насчитывавшие от двух до пяти построек. Печей в домах не было. Очаги устраивались в полуземлянках и ямах, вырытых в полу жилищ.