Тайна жизни и смерти. М.: Знание, 1992.
Трудный путь к диалогу. М.: Радуга, 1992.
Быть христианином: Интервью и последняя лекция. М.: Протестант, 1994.
Сказка о происхождении человека: «Урод». М.: Фонд им. А. Меня, 1994.
Домашние беседы о Христе и Церкви. М.: Изд-во Агентства «Яхтсмен», 1995.
Мировая духовная культура. Христианство. Церковь: Лекции и беседы. М.: Фонд им. А. Меня; Нижний Новгород: Нижегород. ярмарка, 1995.
Библейские предания. СПб.: Респекс, 1996.
Магия. Оккультизм. Христианство. М.: Фонд им. А. Меня, 1996.
Первые апостолы. М.: Фонд им. А. Меня, 1998.
Отец Александр Мень отвечает на вопросы слушателей. М.: Фонд им. А. Меня, 1999.
Исагогика: Курс по изучению Священного Писания: Ветхий Завет. М.: Фонд им. А. Меня; Общедоступный православный университет, 2000.
Читая Апокалипсис: Беседы об Откровении святого Иоанна Богослова. М.: Фонд им. А. Меня, 2000.
Верую… Беседы о Никео-Цареградском Символе веры. М.: Фонд им. А. Меня, 2001.
Библиологический словарь. В 3 т. М.: Фонд им. А. Меня, 2002.
Библия и литература: Лекции. М.: Фонд им. А. Меня, 2002.
О Христе и Церкви: Беседы и лекции. М.: Фонд им. А. Меня, 2002.
Умное небо: Переписка протоиерея Александра Меня с монахиней Иоанной (Ю. Н. Рейтлингер). М.: Фонд им. А. Меня, 2002.
Из современных проблем Церкви. М.: Фонд им. А. Меня, 2004.
Прости нас, грешных. Слово перед исповедью. М.: Фонд им. А. Меня, 2004.
О себе… Воспоминания, интервью, беседы, письма. М.: Жизнь с Богом, 2007.