Всего в 1944–1953 гг. в Эстонии были репрессированы около 36 000 человек, в основном по обвинению в коллаборационизме, а также за участие и поддержку антисоветских партизанских формирований.

Депортированных отправляли главным образом в Красноярский край и Новосибирскую область.

* * *

В послесталинский период, когда генеральным секретарем коммунистической партии СССР стал Н. С. Хрущёв, наступила политическая «оттепель». В 1956 году началось возвращение депортированных. Эстонская коммунистическая партия получила определенную независимость от Москвы в управлении республикой. В последующем, впрочем, политика либерализации была пересмотрена. В ответ на это ужесточение в Эстонии возникло политическое инакомыслие и движение против советизации.

Во второй половине 1970-х активизировалось диссидентское движение.

В конце сентября – начале октября 1980 года в Эстонии прошли антисоветские студенческие волнения, но их жестко подавили правоохранительные органы.

В 1975 году лидеры стран Европы, США и Канады подписали в Хельсинки Заключительный акт Совещания по безопасности и сотрудничеству в Европе. По мнению МИД СССР, это означало признание де-факто вхождение той же Эстонии в состав Советского Союза (нерушимость границ). Однако перед этим Совещанием президент США Джеральд Форд специально подчеркнул, что подписание этого акта не означает признание инкорпорации прибалтийских стран. И потом страны Запада постоянно напоминали о непризнании аннексии Эстонии и других прибалтийских государств.

* * *

В 1987 году началось национальное пробуждение, вызванное перестройкой советского общества, объявленной новым лидером СССР М. С. Горбачевым. Протесты против системы становились все более открытыми и частыми.

В 1988 году началась мощная политическая активизация общества. В апреле был создан Народный фронт Эстонии под руководством Эдгара Сависаара и профессора Марью Лауристин. Появилось и более радикальное национальное движение, нацеленное на достижение независимости.

Одним из крупнейших событий стала упомянутая выше акция «Балтийский путь», в которой приняли участие около двух миллионов жителей Литвы, Латвии и Эстонии.

16 ноября 1988 года Верховный Совет Эстонской ССР объявил о суверенитете Эстонии. Одновременно активизировались политические силы, представлявшие русскоязычное население и нацеленные на сохранение Эстонии в составе СССР.

Народный фронт стал крупнейшей политической силой Эстонии, победив на выборах делегатов Съезда народных депутатов СССР и в Верховный Совет ЭССР в 1989–1990 гг.

К этому времени его программная позиция состояла в достижении независимости на основе провозглашения нового Эстонского государства (третьей республики).