Против коннетабля сложился заговор, в котором участвовали король Наварры Карл Злой, его брат Филипп и три графа Гаркур. В 1354 г. Карл Испанский был убит в собственной постели.
Иоанн II был вне себя от гнева, однако вынужден был простить убийц своего фаворита, так как боялся, что в противном случае наваррцы перейдут на сторону Англии.
В 1335 г. возобновились военные действия между Англией и Францией.
Эдуард Черный принц разорил южные провинции Франции, захватил Нарбон, Каркассон и еще около 500 городов.
Французская казна была пуста, и в августе 1355 г. Иоанн II созвал Генеральные штаты, чтобы просить позволения ввести дополнительные налоги. Разрешение было получено, однако Генеральные штаты создали специальную комиссию, которая должна была контролировать сбор и трату денег.
Введение новых налогов привело к народным волнениям.
В 1356 г. дофин Карл прибыл в Нормандию, чтобы принять присягу у своих вассалов, однако некоторые из феодалов встретили Карла с откровенной враждебностью. Карл Злой подговорил графа Жана Гаркура оскорбить дофина и его отца. Карл сделал вид, что не заметил дерзости графа. Дофин пригласил Карла Злого, Жана Гаркура и еще нескольких нормандских вельмож на пир. В разгар застолья гости были арестованы. Графа Горкура и нормандских вельмож сразу же обезглавили, а Карла Злого заточили в одном из замков в Пикардии.
В ответ их родственники Филипп Наваррский и Годфруа Гаркур перешли на сторону Англии. Теперь помимо войны с англичанами Иоанн II должен был вести войну с Наваррой.
Эдуард Черный принц решил пересечь Францию из Бордо в Нормандию, чтобы соединиться с мятежными феодалами.
19 сентября 1356 г. в решающем сражении у Монпертюи англичане разгромили войско Иоанна II, пленив короля и его младшего сына Филиппа. Поражение у Монпертюи было еще тяжелей, чем при Креси. В бою полегли лучшие рыцари, а противник захватил богатую добычу.
В плену с Иоанном II обходились почтительно и уважительно. В 1357 г. его переправили в Англию, где он жил в Виндзоре на правах гостя.
В 1359 г. Эдуард согласился отпустить Иоанна II за выкуп в 4 млн золотых экю и более десятка французских провинций. Генеральные штаты отвергли эти условия, после чего Иоанн был посажен в Тауэр.
В 1360 г. в Бретиньи дофин Карл подписал мирный договор, по которому Англия получала Сентонж, Биггор, Лимузен, Керси, Пуату, Понтье и Гиень, а также выкуп в 3 млн золотых экю.
Иоанн II вернулся на родину, но французская казна не располагала средствами на выплату выкупа. Королю пришлось занимать деньги у городов и феодалов. Свою дочь Изабеллу Иоанн II выдал замуж за миланского герцога Галеаццо Висконти в обмен на крупную сумму денег. Несмотря на все старания короля, денег все равно не хватало. Кроме того, принц Людовик Анжуйский, оставленный у англичан в качестве заложника, сбежал. Узнав об этом, Иоанн немедленно отбыл в Англию, чтобы заменить его в плену. Эдуард был поражен благородством французского монарха.