Преследование группировки Шакро привело к громким арестам в самом Следственном комитете: по версии ФСБ, после ареста Андрея Кочуйкова в декабре 2015 года ряд высокопоставленных сотрудников СКР получили две взятки за его освобождение из-под стражи. Деньги платили два бизнесмена, формально никак не связанные с Шакро. Глава управления межведомственного взаимодействия и собственной безопасности СКР Михаил Максименко, его заместитель Александр Ламонов и замглавы ГСУ СКР по Москве генерал Денис Никандров были задержаны в июле 2016 года, спустя год — другой заместитель Максименко Денис Богородецкий; в конце 2017-го под арест был взят экс-руководитель управления СКР по ЦАО Алексей Крамаренко.

Одновременно с процессом над Шакро в Мосгорсуде проходил суд по выделенному в отдельное производство делу полковника Максименко. В четверг, 29 марта, гособвинитель Игорь Потапов запросил для бывшего главы управления межведомственного взаимодействия и собственной безопасности СКР наказание в виде 15 лет колонии и 165 млн рублей штрафа.

В отношении другой стороны конфликта на Рочдельской адвокат Буданцев, застреливший, по версии следствия, двоих участников группировки Кочуйкова, обвинялся в превышении необходимой самообороны. В качестве меры пресечения ему был выбран домашний арест — на этом настояли сотрудники управления «М» ФСБ, которые называли Буданцева ветераном КГБ, коллегой, участником спецопераций. В декабре 2017 года было прекращено уголовное преследование Буданцева.

28 марта 2018 года Никулинский суд Москвы приговорил вора в законе Захария Калашова (Шакро-молодого) к 9 годам и 10 месяцам колонии строгого режима по делу о двух эпизодах вымогательства.

Однако для Шакро этим приговором дело может не ограничиться: он уже проходит подозреваемым по делам о даче взятки сотрудникам СКР и организации преступного сообщества.

Ближайшие подручные Калашова — Андрей Кочуйков и Батыр Бекмурадов — согласно решению судьи Константина Дубцова получили 8 лет 10 месяцев и 9 лет 4 месяца строгого режима соответственно. Также на различные сроки — от 7 лет 4 месяцев до 8 лет 4 месяцев — осуждены еще девять членов банды Шакро. […] Бывшему полковнику Суржикову — 7 лет 10 мес., и поскольку он, единственный из них, находился под домашним арестом, то взят под стражу в зале суда. Остальным: Эдуарду Романову и Николаю Николаеву — по 8 лет 4 месяца. Зелимхану Патиеву, Александру Голубеву, Яну Сорокину, Вадиму Прохорову, Алексею Максимову и Герзону Гамидову — по 7 лет 4 месяца. Всем— строгий режим.

Позже Мосгорсуд приговорил к 13 годам строгого режима и штрафу в 165 млн рублей Михаила Максименко, первого из фигурантов разбирательства с коррупцией в СКР. Бывший начальник главного управления межведомственного взаимодействия и собственной безопасности (УМВиСБ) комитета признан виновным в получении двух взяток на 550 тыс. долларов. Львиную долю этих денег, как установил суд, ему давали за освобождение из СИЗО Андрея Кочуйкова (Итальянца), который вместе со своим патроном, вором в законе Захарием Калашовым (Шакро-молодой), уже получил срок за вымогательство. Этот приговор может стать не последним для лишенного судом полковничьих погон Максименко — следователи ФСБ расследуют в отношении него еще несколько уголовных дел.