После убийства Столыпина, которое Гучков воспринял как окончательное крушение надежд на продолжение реформ, он занимал все более критическую позицию по отношению к власти, перейдя фактически в оппозицию. Инициировав думский запрос в связи с гибелью Столыпина, лидер октябристов выступил 16 октября 1911 г. с резкой речью, заявляя не только о «несостоятельности нашей политической полиции», практикующей методы провокации и нуждающейся в кардинальной «чистке», но и поднимал вопрос о вероятном политическом убийстве премьера: «Есть ли это простое служебное нарушение долга, неряшество, бездействие власти или за этим скрывается нечто хуже – сознательное попустительство, желание устранить человека, который стал уже неудобен?» (А. И. Гучков в Третьей Государственной думе (1907–1912 гг.): (Сборник речей). СПб., 1912. С. 158–168).

Александр Иванович первым начал обличать с думской трибуны влияние Г. Е. Распутина и «темных сил», подвергать сокрушительной критике военного министра В. А. Сухомлинова за неудовлетворительную работу по укреплению мощи армии, разоблачать шпионскую деятельность людей из ближайшего окружения министра («дело Мясоедова»). Следствием громких разоблачений, превративших Гучкова, по сути, в личного врага Николая II и императрицы Александры Федоровны, стало противодействие властей переизбранию лидера октябристов осенью 1912 г. в 4-ю Думу и, в целом, поражение партии на выборах (на его взгляд, фальсифицированных). В ноябре 1913 г., на конференции октябристов, Гучков заявил о провале попыток реформирования царского режима на либеральных принципах и приближении революции. Он констатировал «возрождение реакции» «среди всех тех, кого новый политический строй выбросил за борт», усиление влияния «безответственных, внеправительственных и сверхправительственных… и антиправительственных течений, органически связанных с формами русского абсолютизма». Главным практическим выводом он объявлял необходимость перехода либералов в открытую оппозицию бездарной власти: «Историческая драма, которую мы переживаем, заключается в том, что мы вынуждены отстаивать монархию против монарха, церковь против церковной иерархии, армию против ее вождей, авторитет правительственной власти – против носителей этой власти» (Гучков А. И. Речи по вопросам государственной обороны и общей политике: 1908–1917. Пг., 1917. С. 98–112).

После вступления России в войну, в августе 1914 г., Гучков отправился на фронт в качестве особоуполномоченного Красного Креста, занимался организацией госпиталей и снабжением их всем необходимым. Летом 1915 г. возглавил Центральный военно-промышленный комитет (ЦВПК), созданный по инициативе представителей промышленных и финансовых кругов (в том числе и Гучкова). В сентябре 1915 г. избран в Государственный совет от торгово-промышленной курии и стал одним из лидеров оппозиционного Прогрессивного блока. В конце 1916 – начале 1917 гг. занимался организацией «дворцового переворота», целью которого было отречение Николая II в пользу наследника, царевича Алексея, при регентстве великого князя Михаила Александровича. В дни Февральской революции активный участник событий в Петрограде. 2 марта, выехав в Псков как представитель Временного комитета Государственной думы вместе с депутатом В. В. Шульгиным, получил отречение Николая II от престола.