Военный губернатор Сыр-Дарьинской области генерал-лейтенант Александр Семенович Мадритов выдвинул мятежникам ультиматум:

«Пусть не думают мятежники, что они могут скрыться куда-либо – везде найду и накажу жестоко, также жестоко пострадают и их семейства, и все те, кои им помогали. Накажу так жестоко, что долго будут помнить их предки и их потомки много сот лет».

«Пусть не думают мятежники, что они могут скрыться куда-либо – везде найду и накажу жестоко, также жестоко пострадают и их семейства, и все те, кои им помогали. Накажу так жестоко, что долго будут помнить их предки и их потомки много сот лет».

Точное количество жертв трагических событий периода восстаний в Туркестане – от нескольких тысяч жертв среди коренного населения края до 60 тысяч, погибших на горных перевалах и в реках при паническом бегстве потерпевших поражения мятежников и их семей. Погибло около 8 тысяч русских переселенцев, в большинстве стариков, женщин и детей. Уничтожено около 9 тысяч хозяйств русских переселенцев. Генерал-губернатор А.Н. Куропаткин распорядился конфисковать у коренного населения земли, где происходили массовые убийства русских людей.

Боевые действия против мятежников завершены 25 января 1917 года.

В итоге полугодовой военной карательной эпопеи вместо первоначально запланированных 480 тысяч человек удалось мобилизовать на тыловые работы лишь немногим более 120 тысяч инородцев. Такова оказалась цена непродуманного и поспешно подготовленного царского высочайшего повеления.

Боязнь подвергнуться репрессиям и мести за участие в восстании стала одной из причин так называемого большого исхода – массового бегства казахов и киргизов в количестве от 100 до 250 тысяч человек в Китай.

На заседании Государственной думы 13 декабря 1916 года депутат Керенский даст жесткую оценку карательным операциям русских войск. Обращаясь к собравшимся, он патетически восклицает:

«…послушайте, как эпически спокойно рассказывается то, что происходило недавно в горах Семиречья, в официальной газете: “Известное возмездие уже постигло, конечно, мятежников, войсками перебито много тысяч киргизов. Их стойбища уничтожаются, огромное количество их стад переходит в руки войск, администрации. Но это не всё. Главный результат комбинированных действий войск заключается в том, что все мятежники загнаны сейчас в такие горные районы, где вскоре вследствие холода и голода они в полной мере почувствуют последствия своего безумного восстания. Уже доходят сведения об их лишениях и болезнях среди них, но войскам приказано не давать врагу пощады”». Далее, говоря о загнанных в горы людях, Керенский утверждает, что это не мятежники, а «главным образом женское киргизское население, которое, когда был объявлен указ и начались беспорядки, огромными массами, целыми родами поднялось с долин и пошло в горы искать себе нового убежища, новой родины в Китае. Их восстание было восстание пассивное. Они хотели одного – уйти в Китай, покинуть старую родину, столь жестоко с ними обошедшуюся. И вот когда эта масса киргизского населения с долин, от рек постепенно поднималась в горы и скапливалась в проходимых ущельях, стремясь уйти из России, здесь проводились эти комбинированные действия войск, и эта масса женщин, детей, взрослых и стариков обрекалась холодно и спокойно на голодную смерть».