В 1946 году Бориса Моисеевича перевели с промысла в руководство треста и назначили начальником геологического отдела.

В тресте Борис Моисеевич возглавил работу по анализу разработки всех нефтеносных пластов месторождения. Совместно с научными институтами были составлены проекты доразработки пластов.

Борис Моисеевич придавал большое значение применению геофизических методов исследования скважин и пластов, а также новым радиоактивным методам разведки. Он был пионером в области изучения полной радиоактивной характеристики всего разреза Балаханы-Сабунчи-Раманинского месторождения. Вместе с работниками треста «Азнефтегеофизика» им были разработаны и внедрены новаторские методы исследований, в частности метод непрерывного замера при определении поглощающих пластов, метод контроля качества цементировки скважин с помощью радиоактивных изотопов, методы определения профиля поглощения, методы контроля гидравлического разрыва пластов, метод определения контакта нефти и воды в эксплуатационном объекте и проч. Без преувеличения можно сказать, что в нефтяной промышленности республики Борис Моисеевич считался лучшим, непревзойденным специалистом.

В 1948 году Бориса Моисеевича пригласили на работу в трест «Азнефтегеофизика» на должность главного геолога, и новое место службы было ему очень по душе, но в следующем году скоропостижно скончался главный геолог треста «Лениннефть», и в тот же день все тот же первый секретарь ЦК Компартии Азербайджана Мир-Джафар Багиров распорядился вернуть Бориса Моисеевича Листенгартена на должность главного геолога треста «Лениннефть».

Борис Моисеевич Листенгартен с женой Эсфирью Львовной на отдыхе. Рига, 1958

Борис Моисеевич Листенгартен с женой Эсфирью Львовной и сыном Леонидом в Эчмиадзине (Армения). Леонид вместе с ними прямо в рабочей одежде поехал из г. Казаха, где работал, на пару дней в Армению

Таким образом, спустя двенадцать лет Борис Моисеевич вновь стал главным геологом крупнейшего нефтедобывающего треста республики. Он проработает на этой должности пятнадцать лет, его наградят орденом «Знак Почета», присвоят звание Заслуженного инженера Азербайджана. Все эти годы Борис Моисеевич наряду с производственной работой продолжал заниматься научными исследованиями, которые помогали поддерживать высокие уровни добычи нефти на месторождении. В 1963 году вышла его книга «Радиоактивные методы в нефтепромысловой геологии», по которой он защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата геолого-минералогических наук.

В 1964 году Борис Моисеевич перешел на должность заведующего лабораторией НИИ глубинных нефтегазовых месторождений Азербайджанской академии наук, где продолжил научные исследования в области разработки нефтяных, газовых и газоконденсатных месторождений. Он защитил диссертацию на соискание ученой степени доктора наук, ему присвоили звание профессора.