В 1941–1947 годах — заместитель наркома связи СССР. В период войны награжден орденом Трудового Красного Знамени, орденом Ленина и медалями. В 1945 году стал первым председателем Всесоюзного научного общества радиотехники и электросвязи имени А. С. Попова.
В мае 1947 года ему поручили возглавить советскую делегацию на первую (после войны) Полномочную конференцию Международного союза электросвязи в городе Атлантик-Сити (США). Активно участвуя в работе этой конференции, А. Д. Фортушенко приобрел большой авторитет в международном сообществе и был избран на престижный для нашей страны пост председателя Административного совета МККР. Задачи, поставленные правительством перед советской делегацией, были полностью выполнены, однако для Александра Дмитриевича неожиданно наступил резкий и трагический поворот в судьбе. В то время в стране стала подниматься волна шпиономании, и начались поиски врагов. После возвращения из командировки он был обвинен в том, что нелегально вывез за границу данные о частотах, на которых работали отечественные вещательные станции. На этом основании он был арестован, его судили и, несмотря на заслуги перед государством, как врага народа приговорили к 25 годам заключения.
К счастью, он не погиб в сталинских лагерях и не утратил силу духа. В 1954 году был полностью реабилитирован и назначен начальником Главного технического управления Минсвязи СССР.
С октября 1957 года — начальник НИИР. В 1967 году защитил докторскую диссертацию по вопросам космической радиосвязи, телевидения и радиовещания.
* * *
Фортушенко возглавлял НИИР 20 лет и, надо сказать, очень поднял за эти годы уровень выполняемых проектов, фундаментальных научных исследований и в целом престиж института. Он сам руководил некоторыми разработками, и у него был непререкаемый авторитет ученого.
Александр Дмитриевич поставил мне тогда очень амбициозную, но в то же время деликатную задачу: сделать отдел телевидения НИИР лидером научных исследований в нашей отрасли. Этому в отделе пока уделялось еще недостаточно внимания. Прикладные задачи телевидения решались тогда в разных организациях и, конечно, в НИИР довольно успешно, а вот научную базу следовало укрепить, особенно для перспективных разработок, которыми начинали заниматься в институте.
К моменту моего прихода в отделе телевидения НИИР обязанности начальника исполнял уважаемый Сергей Васильевич Новаковский. Он организовал работы таким образом, что здесь делали все, имеющее отношение к телевидению: камеры, объективы, усилители и так далее. Но вопросами передачи телевизионных сигналов по каналам связи практически не занимались. А вопросов было очень много, когда такая крупная сеть развивалась и решения нужны были срочно.