За год с небольшим до смерти у Кеннеди произошел конфликт с заправилами сталелитейной промышленности, ведущей отрасли экономики США. Президент был вынужден тогда бороться с инфляцией и ожидал помощи от «королей стали». Но те вместо этого неожиданно подняли цены на свою продукцию. Кеннеди нанес ответный удар: приказал Пентагону покупать сталь не у крупнейшей американской компании «Ю. С. стил», а у тех компаний, которые воздержались от повышения цен. «Короли стали» пришли в бешенство, но потеря заказов Пентагона означала для них потерю колоссальных прибылей, и они уступили, отменив повышение цен. История США гласит, что за последние 60 лет ни один американский президент не осмеливался ссориться со сталепромышленниками и тем более посягать на их интересы. Орган деловых кругов «Уолл-стрит джорнэл» назвал действия президента «грубым нажимом», а «Общество Джона Бэрча» объявило Кеннеди «агентом России», подрывающим основы капиталистического строя. В самом деле, консервативно мыслящими деловыми людьми действия президента были восприняты как покушение на частную собственность — святая святых капиталистического общества. Такое преступление, бизнес не может простить никому, даже президенту США.

В то же самое время Кеннеди столкнулся с еще одной проблемой. Дело в том, что к 1961 году движение американских негров за свои права приняло такой размах, что вышло из-под контроля властей. Вот-вот могла начаться открытая война между белыми и черными американцами. Правительство, хотело оно того или нет, было вынуждено выступить с новыми инициативами в этой области. Конкретно они выразились в отрицательном отношении Кеннеди к расовой сегрегации в университетах Миссисипи и Алабамы. Известный расист, губернатор штата Алабама Джордж Уоллес заявил, что ни за что не уступит давлению администрации Кеннеди в этом деле. Тогда президент заставил Уоллеса подчиниться федеральным властям под угрозой вмешательства войск в управление Алабамой. К тому же Кеннеди выдвинул, хотя и довольно умеренный, законопроект, направленный против расовой дискриминации. Понятно, что этими действиями он вызвал ненависть у всех расистских сил страны, которых там, как известно, немало.

Другим столкновением Кеннеди с силами, убившими его, стал возникший в США конфликт по поводу вторжения на Кубу. Еще в 1960 году, при президенте Эйзенхауэре, были созданы на территории США вооруженные отряды из кубинских эмигрантов. Мало этого — была также создана специальная группа по разработке плана против Кубы. В группу эту входили представители ЦРУ, Пентагона и госдепартамента, они разрабатывали операцию вторжения кубинских контрреволюционеров при поддержке вооруженных сил США. Последнее эти стратеги считали абсолютно необходимым условием, так как «армия» контрреволюционеров-эмигрантов была смехотворно мала. Когда Кеннеди стал президентом, директор ЦРУ, небезызвестный Аллен Даллес, посвятил его в этот план. Кеннеди утвердил его, но отклонил предложение об участии во вторжении вооруженных сил США. Как известно, в апреле 1961 года десант контрреволюционеров на Кубу был полностью разгромлен. Во время боевых действий в заливе Кочинос ЦРУ и Пентагон неоднократно требовали у Кеннеди ввести в действие вооруженные силы США. Президент на это не пошел. Гнев руководителей американской разведки и армии не имел предела! Главное ответственное лицо за операцию в заливе Кочинос, заместитель директора ЦРУ, генерал Чарлз Кэйбелл публично назвал Кеннеди предателем.