В 1961 году Марчелло созвал в Новом Орлеане руководителей «Коза ностры», и там было решено приступить к разработке планов по убийству Джона и Роберта Кеннеди. Сообщение об этом поступило в министерство юстиции от тайного осведомителя ФБР, присутствовавшего на этом совещании. Донесение агента было положено под сукно.

В том же году в ФБР поступило и другое предупреждение о готовящемся покушении на президента США. Состоятельный кубинский эмигрант Хосе Ареман сообщал о своем разговоре с одним из боссов «Коза ностры» Сантосом Трафиканте. Последний сказал Ареману о том, что Джон Кеннеди будет убит. Как ФБР отреагировало на сообщение Аремана? Во-первых, он был предупрежден о том, что не должен ни с кем делиться этими сведениями. Во-вторых, после убийства президента Дремана посетили два агента ФБР и велели помалкивать.

Администрация Кеннеди угрожала спокойствию и благополучию еще одного из руководителей «Коза ностры» — Сэма Джанканы. С лета 1963 года он попал под постоянное наблюдение полиции и был скован в своей преступной деятельности. Ощущали на себе заметное давление властей и другие гангстерские боссы. И не случайно именно они стали затем режиссерами убийства президента. Мало этого — многие из них сами поплатились за это убийство своей жизнью, поскольку заговорщики убирали свидетелей и исполнителей также среди своих, следуя старому закону «Коза ностры», который гласит: «Молчат только мертвые свидетели».

Гангстерские боссы, имена которых связаны с делом Кеннеди, вовсе не случайно еще до покушения на президента были известны как мастера по организации убийств. Так, «названный выше Сантос Трафиканте специализировался в «Коза ностре» именно на этом поприще, причем был он, разумеется, не простым исполнителем, а искуснейшим организатором тайных покушений. Его коллега Сэм Джанкана тоже был режиссером многих таких «мокрых дел». В связи с разоблачениями деятельности ЦРУ имя его всплыло, когда заговорили о покушениях на жизнь зарубежных высокопоставленных деятелей, организованных совместными усилиями ЦРУ и «Коза ностры». Было установлено участие Джанканы в нескольких заговорах с целью убить Фиделя Кастро. От такого обвинения, как мы теперь знаем, идет прямая ниточка к убийству Кеннеди. Старого гангстера вызвали летом 1976 года на допрос в сенатскую комиссию. Чтобы он никуда не исчез, дом его был буквально осажден агентами ФБР и чикагской полицией. Тем не менее (вернее, именно поэтому!) Джанкана был убит неизвестными лицами в собственном доме, их, разумеется, не нашли до сих пор.