15 января 1814 г. в Баратарии проходила распродажа рабов и награбленных товаров. Таможенное ведомство отправило 12 солдат во главе с лейтенантом Стаутом для конфискации нелегального товара, но по прибытии на место отряд был атакован, Стаут убит, а двое солдат ранены. Спустя два месяца окружной прокурор докладывал губернатору штата, что за полгода пиратами было завезено в Баратарию товаров на 1 млн. долл. По меньшей мере, 7io часть жителей Нового Орлеана была связана с нелегальной торговлей, и в иные дни в пиратском логове собиралось до 500 скупщиков краденого.

3 сентября в Баратарию прибыл британский бриг под командованием капитана Локкайера. Последний передал Жану Лафитту письмо генерала Николса, командующего английскими войсками во Флориде. Шла война между Британией и США, и англичане хотели использовать флибустьеров Баратарии в качестве лоцманов. Лафитту предлагали чин капитана 1-го ранга и 30 тыс. долл., но он отказался сотрудничать с англичанами, о чём уведомил губернатора Луизианы. Последний простил пирату его прошлые прегрешения и закрыл глаза на бегство Пьера Лафитта из городской тюрьмы. В то же время коммодор американского флота Дэниэл Т. Паттерсон и командир 44-го пехотного полка полковник Т. Росс, имея инструкции морского министра атаковать пиратскую базу в Баратарии, 11 сентября подготовили против флибустьеров карательную экспедицию. 16 сентября американские солдаты атаковали Баратарию, захватили стоявшие там суда и взяли в плен 80 пиратов, в том числе старшего брата Лафитта — Доминика по прозвищу Капитан Доминго. Укрепления Баратарии были срыты, дома разрушены.

17 декабря, в связи с угрозой британского вторжения в Луизиану, генерал Джексон приказал выпустить из тюрьмы баратарийцев, изъявивших желание сражаться против англичан, и обещал передать президенту прошение о помиловании бывших пиратов. 23 декабря началось сражение за Новый Орлеан. Все попытки англичан захватить город были отбиты, баратарийцы, охранявшие форт Сент-Джон на северной окраине, проявили невероятную стойкость. В первых числах января 1815г. англичане отступили. Генерал Джексон официально поздравил экс-флибустьеров Капитана Доминго и Рене Белюша, командовавших 3-й и 4-й батареями, и отметил «мужество и верность» братьев Лафиттов. В середине марта того же года из Вашингтона в Новый Орлеан доставили декрет о прощении баратарийцев. Документ был подписан президентом США Мэдисоном.

Хотя братья Лафитты получили амнистию, их имущество было конфисковано. Чтобы поправить дела, они решили снова заняться незаконным промыслом — контрабандной торговлей и пиратством. 23 марта 1817 г. братья прибыли на шхуне «Кармелита» к о. Галвестон в Техасе, где вели переговоры с французским корсаром Луи д’Ори и мексиканским партизаном Франсиско Миньей. 7 апреля флотилии д’Ори и Минья отплыли из Галвестона на освобождение Мексики, а Жан Лафитт приступил к оборудованию на острове своей базы.