В каждой гондоле первоначально устанавливалось по одному восьмицилиндровому рядному дизельному двигателю Бердмор «Торнадо» водяного охлаждения. Предполагалось, что двигатели будут развивать мощность 700 л. с. каждый, однако действительная мощность оказалась всего 685 л. с. при 1000 об/мин. Первоначально предполагалось поставить металлические винты с изменяемым шагом, однако во время испытания обнаружилось, что пустотелые металлические лопасти этих винтов (диаметром 5 м) не выдерживают высоких вращательных моментов. Поэтому их заменили на деревянные.
Один из двигателей имел реверсивный винт для торможения и обратного хода. Вначале предполагалось сделать реверсивным двигатель кормовой моторной гондолы, однако потом от этого отказались, так как задний двигатель давал возможность использовать струю потока от винта кормового двигателя для усиления эффективности оперения при маневрировании. Запуск двигателей производился при помощи 40-сильных бензиновых моторов «Рикардо», снабженных передачей «Бендикс». Из четырех вспомогательных пусковых моторов два могли служить также для перекачки горючего и водяного балласта из одного бака в другой.
Вся винтомоторная группа на дирижабле R.101 оказалась очень перетяжеленной. В процессе строительства и испытания моторов пришлось некоторые части заменить другими. В результате вес всей винтомоторной группы составил 21 т — на 8 т больше, чем планировалось. Горючее помещалось в баках емкостью по 1020 и 610 л каждый. Большинство баков располагались в районе главных шпангоутов дирижабля, часть — подвешивались к пассажирским платформам. Это было сделано с целью компенсировать (путем перекачки части горючего в эти баки из других) облегчение веса соответствующего отсека при уменьшении количества пассажиров на корабле. Общая емкость баков была рассчитана на 29 т горючего.
Баки для балласта, делились на две группы: одна, рассчитанная на 8 т водяного балласта, и другая — на 7 т. Баки первой группы были устроены так, что могли быстро сбрасывать весь содержащийся в них водяной балласт. Дно этих баков снабжалось поворачивающимся диском. При его повороте, примерно на 1/7 окружности, он опускался, оставляя открытым отверстие в 306 мм в диаметре, через которое бак быстро опорожнялся. Баки другой группы, рассчитанные на 7 т водяного балласта, по своему устройству не отличались от баков для тяжелого горючего и для увеличения радиуса действия дирижабля могли также заполняться горючим. На случай очень продолжительного полета предполагалось заполнять горючим и баки для балласта первой группы. Водяной балласт также мог перекачиваться из одного бака в другой для поддержания продольной устойчивости дирижабля. Благодаря такой системе перекачки дирижабль мог на стоянке выгрузить и горючее, и балласт почти в любом месте вдоль каркаса.