«Трех Иерархов» 66 прибыл в Аузу из Ливорно 27 февраля, а «Европа» 66 со Спиридовым на борту – 8 марта. Командующий с кораблями «Чесма» 80, «Трех Иерархов» 66 и фрегатом прибыл в порт Мария 17 марта, а корабли с Миконоса – 11 апреля. Орлов и Грейг – оба ушли в Ливорно на «Победе» 66 27 апреля, оставив командование флотом Спиридову, который прибыл из Аузы 28 мая.
Два фрегата, «Надежда» 32 и «Св. Павел» 26, ушли с Миконоса к сирийскому побережью 6 июня. В районе Сидона 4-го к ним присоединились «Св. Николай» 26, «Накция» 22 и «Слава» 16 с полякрами «Св. Алексий» 20, «Св. Анна» 20, «Св. Екатерина» 18, «Сникс» 12, «Дендра-Дездра» 12[15], шхуной «Забияка» и 6 полугалерами. Двумя днями позже этот флот под командованием капитана «Надежды» Кожухова появился у Бейрута. После обстрела последовала блокада с суши и с моря, и 10 октября город сдался.
Другое соединение вышло в море 17 июня и стало курсировать вдоль побережья Морей. Оно состояло из линкора «Св. Януарий» 66 и двух фрегатов, «Парос» и «Делос», но на «Св. Януарии» обнаружилась течь, и в начале августа его сменила «Победа» 66, только что вернувшаяся из Ливорно, а также добавились «Не тронь меня» и «Констанция». Все соединение вернулось в Аузу 4 ноября.
Спиридов разбил остальной флот на три дивизии. Первая – под его командованием – состояла из линкоров «Европа», «Всеволод», «Чесма», «Ростислав», «Граф Орлов», фрегата «Запасный» и полякры «Патмос». Вторая, под командованием контр-адмирала Елманова, состояла из 4 линкоров, «Св. Георгий Победоносец», «Трех Святителей», «Трех Иерархов», «Саратов», трех фрегатов, «Северный орел», «Тино», «Победа», трех бомбардирских кораблей и пинки «Соломбала». Третья состояла только из пакетбота «Почтальон» и семи небольших судов.
Все три дивизии вышли из порта Мария 10 августа. На следующий день корабли Спиридова бросили якоря в районе Самоса, а Елманов, оставив «Трех Святителей», «Трех Иерархов», «Тино» и «Победу» для блокады острова Кос, перешел к Бодруму, расположенному неподалеку на материковом побережье. Он обстрелял форт и высадил десант, который причинил определенный ущерб. Высланные с корабля лодки уничтожили две полугалеры и фелуку, но турецкий фрегат оказался слишком близко к стенам крепости, и до него не добрались. Обстрел продолжался всю ночь и следующий день, 12 августа. Было отмечено попадание в турецкий корабль, однако ущерб оказался небольшим.
16-го Елманов перевел свой флот к острову Кос, где 19-го к нему присоединилась третья дивизия. Он добавил к этой дивизии три фрегата и два бомбардирских корабля, а остальной флот повел на соединение с кораблями Спиридова. Те уже ушли с Самоса и бросили якоря между островками Липсо и Аркиус, на полпути между Самосом и Косом. Сюда 26-го подошли корабли Елманова, а третья дивизия 24-го бросила якоря у острова Лерое.