Падение Миссолонги позволило Ибрагиму вернуться в Морею и возобновить стремительную войну. Совершая марши от одного места к другому, чтобы поддержать свои разбросанные гарнизоны и подавить сопротивление таких же разбросанных отрядов повстанцев, Хюсрев с 40 кораблями 11 мая ушел из Патрасского залива в Дарданеллы, египтяне двумя днями позже сделали то же самое и 20-го ушли из Наварина в Александрию.
Теперь планировалась еще одна атака на Самос, и турки, чей страх перед греческими брандерами за последнее время ослаб, снова начали использовать линейные корабли. Одна дивизия из 2 линкоров и 20 небольших судов вышла из Дарданелл 6 июля и прибыла к Наварину 13-го, а вторая, под командованием Хюсрева, 12 июля отправилась к Хиосу. В ней было 2 линкора, 27 фрегатов или корветов и 7 бригов.
Тем временем жители Самоса позвали на помощь и предоставили средства, позволившие кораблям с Гидры прийти на помощь. К счастью, Хюсрев оставался у Хиоса до 24 июля, и это позволило Сахтурису, который покинул Гидру днем раньше с 33 кораблями и 8 брандерами24, прибыть к Самосу вовремя. 27 июля, в день после его прихода, впервые были замечены турки. Последовала 3-часовая перестрелка с дальнего расстояния. Были зря сожжены два греческих брандера. Но ни одна из сторон не понесла ущерба. На следующий день было то же самое. Единственную попытку сблизиться с врагом предпринял Канарис на своем брандере, но и она оказалась неудачной. Брандер пришлось уничтожить, а сам Канарис получил ранение, но все же сумел спастись. Хорошо хоть греческое сопротивление заставило Хюсрева на время отказаться от своих планов и вернуться в Митилену.
В течение следующего месяца ни одна из сторон не проявляла активности. Греки прикрывали Самос и поддерживали коммуникации с Гидрой, но Хюсрев только один раз повел свой флот в направлении Самоса, а заметив противника, удалился на Хиос. После этого он оставил своего заместителя Тахир-пашу у руля, а сам отбыл на фрегате в Фочу, что в заливе Смирны, на ремонт.
4 сентября прибыл Миаулис с 20 кораблями и принял командование у Сахтуриса. Он сразу же вывел флот в море на поиски врага и обнаружил его в Митилене 9-го. Часть турецкого флота вышла навстречу, и вечером 10-го началось сражение между 24 кораблями турок (2 линкора, 6 фрегатов,4 корвета, 9 бригов) и 50 кораблями греков (4 полякры, 44 брига и шхун, причем первые были значительно сильнее по отдельности). Этот бой, который периодически возобновлялся всю ночь и весь следующий день, был упорнее, чем все предыдущие, но не стал более убедительным. У греков затонуло два брандера, один сгорел без всякой пользы, несколько кораблей получили серьезные повреждения, а потери в живой силе составили 100 человек убитыми и ранеными. Турки потеряли 22 человека, и, по их утверждению, вечером 11-го у греков затонуло два судна – возможно, это были брандеры. Вероятнее всего, греки покинули поле боя первыми, но турки последовали их примеру и вернулись в залив Смирны на ремонт.