Самыми рискованными были действия английских сверхмалых подводных лодок "ХЕ-1" и "ХЕ-3" в сингапурской гавани. Туда их на буксире привели соответственно подводные лодки "Спарк" и "Стиджиен". Перед "ХЕ-1" и "ХЕ-3" поставили задачу — проникнуть в гавань и подложить под днища стоявших там тяжелых крейсеров "Такао" и "Миоко" мины замедленного действия. Крейсер "Такао" находился в гавани после атаки его 23 октября американской подводной лодкой "Дартер", а "Миоко" — после того как 13 декабря его успешно атаковал "Бергол". Мины замедленного действия должны были окончательно вывести тяжело поврежденные крейсера из строя. Аэрофотоснимки гавани показали, что крейсера стоят на якорях в районе малых глубин и защищены противолодочными сетями. Правда, оба крейсера, как полагали, находились в состоянии, исключавшем их боевое использование, но поскольку они были на плаву, считалась, что они представляют потенциальную угрозу операциям союзных сил в юго-западной части Тихого океана. Находясь в сингапурской гавани, они были недосягаемы для обычных подводных лодок.

Английский план использовать сверхмалые подводные лодки для подрыва в сингапурской гавани японских кораблей американские подводники считали самым настоящим самоубийством. И все же английское командование решило провести его в жизнь. Около полуночи 30 июля "Стиджиен" привел на буксире "ХЕ-3" в точку в 30 милях к востоку от Сингапура, вблизи маяка Хорсборг. При ярком свете луны "ХЕ-3" прошла по каналу 25 миль и оказалась в гавани. Около 04.30 показались шедшие в направлении лодки корабли, и "ХЕ-3" погрузилась. Весь остальной путь лодка прошла в подводном положении.

Около 10.30 "ХЕ-3" достигла ворот в боновом заграждении, которые оказались открытыми, но охранялись вооружённым траулером. "ХЕ-3" благополучно прошла через эти ворота. Через два часа она обнаружила хорошо закамуфлированный под окружающий ландшафт тяжёлый крейсер "Такао". Пользуясь в основном эхолотом и изредка перископом, Фрейзер вел лодку к цели. Подняв последний раз перископ, Фрейзер увидел на расстоянии всего 25 метров от себя катер. "ХЕ-3" тотчас же ушла на глубину 7,6 метра. Дальше она двигалась по проливу Джохор почти у самого дна, направляясь к стоявшему на якоре "Такао". В 14.42, достигнув борта крейсера, "ХЕ-3" начала маневрировать для последующего выпуска водолазов. Фрейзер опасался, что удар о крейсер мог выдать присутствие лодки. Но все обошлось благополучно, и в 15.32 водолаз спустился, взяв с собой шесть диверсионных мин-детонаторов для подрыва крейсера. Но водолаза едва не постигла неудача. Дело в том, что днище "Такао" обросло настолько, что магниты мин не удерживались на нём. Водолаз проявил находчивость: расположил мины по обе стороны киля и соединил их скобами.