Новый город на Неве стал быстро развиваться. Вскоре после закладки крепости на соседнем Городском острове (ныне Петроградская сторона) возник первый порт с пристанью. Здесь появились административные здания, маленький деревянный домик Петра I, жилые дома. Почти одновременно на противоположном левом берегу был основан «Адмиралтейский дом» - судостроительная верфь, которую год спустя превратили во вторую крепость, окружив ее с трех сторон каналами, земляным валом и рвами. Вслед за этим начал застраиваться и прилегающий к верфи район, куда позже, к 30-м годам XVIII века, с Городского острова переместился центр города.

Десятки тысяч «работных людей», собранных со всех концов страны специальными указами Петра I, осушали болота, прорубали просеки, прокладывали улицы, возводили здания. Работали они в невероятно трудных, каторжных условиях. От голода, болезней, изнурительного труда гибли тысячи людей.

Среди первых зданий Петербурга была и небольшая церковь, построенная в 1710 году на лугу против ворот Адмиралтейской верфи. Она была одноэтажной, с небольшой колоколенкой и лишена архитектурных украшений. Ее простота типична для первых построек Петербурга петровского периода. Церковь сооружалась в честь Петра I. Поскольку день рождения царя совпадал с днем празднования «памяти» легендарного византийского монаха Исаакия Далматского, ее назвали Исаакиевской.

Эта скромная церковь играла роль одной из главных в городе. В ней проходили различные торжественные акты. Здесь венчались Петр I и Екатерина. Есть основания полагать, что бракосочетание «без всякой церемонии и без объявления о нем в народ» состоялось еще в 1707 году, а через пять лет «в удовольствие своей супруги» Петр I решил отметить его публично.

В походном журнале 19 февраля 1712 года записано: «В наступившем году, уже не представлявшем ожидания невзгод, Петр I обвенчался в Петербурге с Екатериной Алексеевной 19-го, во вторник, на всеядной неделе. Венчание его величества совершено утром в Исаакиевском соборе. В 10 часов утра высокобрачные при залпах с бастионов Петропавловской и Адмиралтейской крепости вступили в свой зимний дом…»

Первая Исаакиевская церковь. Литография с рисунка О. Монферрана.

Быстро развиваясь как торговый и военный порт, Петербург не сразу стал политическим и административным центром страны. Несмотря на победы русской армии и флота в 1704 и 1705 годах, опасность еще угрожала городу. Лишь после Полтавской победы в 1709 году Петр I сообщал в письме Апраксину: «совершенно камень в основание Санкт-питербурха положен…» А после взятия Выборга в 1710 году, обеспечившего окончательно безопасность города на Неве, мысль о «новой резиденции» не оставляет Петра.