Самым древним историческим памятником Бухары является крепость Арк (цитадель). Это мощное фортификационное сооружение площадью 3,9 га, протяженность его стен 789 м, высота 16–20 м. Впервые крепость Арк упоминается в документах в Х в., но она была основана гораздо раньше – в VI–VII вв., а первые постройки на ее территории появились в IV–III вв. до н. э. В XVIII–XIX вв. Арк стал центром государственности Бухарского амирата. Он занимал площадь около 4 га и возвышался над окрестностями на 18–20 м. Здесь находилась резиденция правителей Бухары, был гарем, во дворце жили амир со своей семьей, а также чиновники с их семьями, размещалось правительство Бухарского амирата, располагались мечети, казначейство, канцелярия, тюрьма. В этой крепости хранили государственную казну, запасы золота, драгоценности, оружие, находились мастерские. В начале ХХ в. в крепости Арк жили до 3 тыс. человек. В Средние века крепость Арк посещали и жили в ней известные ученые и просветители, в том числе Абу Абдаллах Джафар Рудаки, Абу Наср ибн Мухаммед Аль-Фараби, Ибн Сина (Авиценна), Омар Хайям. За свою долгую историю крепость Арк несколько раз разрушалась, но потом с изменениями, но восстанавливалась. Постройки, которые мы можем видеть сейчас, были возведены в основном в XVII–XIX вв. Очень большой урон крепости был нанесен в 1920 г., когда войска Туркестанского фронта под командованием М.В. Фрунзе вели бои за овладение Бухарой. Тогда большая часть крепостных стен, башен, внутренних строений была полностью или частично разрушена. Из-за его массированного артиллерийского обстрела и авиационной бомбардировки территория Арка превратилась в развалины и пустырь. В наши дни пустырь занимает почти 70 % территории этой цитадели; до сих пор восстановить крепость Арк в ее изначальном виде не удалось. Главные из ее сохранившихся, точнее – посильно восстановленных построек: Джума мечеть (XVIII в.), тронный зал Куриныш-хана (XVII в.) двор премьер-министра – «кушбеги» (XIX – начало ХХ в.), двор приветствий – Салом-хана (XIX – начало ХХ в.) и некоторые другие. В крепости Арк в 1945 г. разместили историко-краеведческий музей, его преобразовали в 1985 г. в Бухарский государственный архитектурно-художественный музей-заповедник (в нем есть отделы: природы, археологии, исторический, нумизматики и эпиграфики, а также выставка памятников письменности XVII–XX вв.). Есть и отдел-филиал заповедника за пределами крепости Арк – это зиндан – бывшая городская тюрьма с камерами, подземным карцером, в его музейной экспозиции – предметы быта узников, их фотографии и портреты.