Несколько слов об обозначениях. Номер эскадры обозначался арабскими цифрами, нумерация эскадр была сквозная в рамках специализации, но не последовательная (например, не могло быть двух 27-х истребительных эскадры, но 27-я истребительная и 27-я бомбардировочная были; наличие 400-й истребительной эскадры не следует понимать, как свидетельство того, что «Люфтваффе» когда-либо насчитывали четыре сотни истребительных эскадр, то есть где-то около 40 000 истребителей). Номер группы ставился перед номером эскадры и обозначался римской цифрой, в свою очередь эскадрилья обозначалась латинской цифрой.

«Воздушный флот» (Luftflotte) представлял собой не только командную, но и административную единицу. В рамках воздушных флотов существовали как более мелкие административные структуры (Luftgau), так и оперативные подразделения. Luftgau, или воздушные округа, нужны были прежде всего для повышения мобильности соединений воздушного флота. В каждом округе имелась собственная служба снабжения, мастерские для ремонта машин, не подлежащих восстановлению в полевых условиях, стационарные системы разведки и обнаружения. Высшее руководство «Люфтваффе» стремилось по возможности унифицировать наземные службы округов, поскольку это позволяло уменьшить наземный штат эскадр, что в свою очередь сокращало время, требуемое для перебазирования части. В каждом округе был старший офицер ПВО, который командовал большей частью (а позже и всей) истребительной авиации своего округа, но — под руководством штаба дивизии или корпуса. Вообще, вся боевая авиация в округе объединялась либо в авиакорпус, либо в авиадивизию — в зависимости от количества и сбалансированности авиационного парка.

Штаб воздушного флота объединял все авиационные структуры — административные и оперативные, действующие на вверенной ему территории.

Верховное командование «Люфтваффе» (ОКЛ) формально подчинялось верховному командованию вермахта (ОКВ), которое должно было координировать взаимодействие между армией, флотом и авиацией. На самом деле все было «не совсем так». Реально при главнокомандующем сухопутными силами (ОКХ) состоял генерал-инспектор, который и организовывал взаимодействие.

Как в любом уважающем себя штабе, в ОКЛ было 9 отделов, а именно:

1. Оперативный отдел

2. Организационный отдел

3. Отдел боевой подготовки

4. Транспортный отдел

5. Разведывательный отдел

6. Отдел снабжения

7. Научно-технический отдел

8. Исторический отдел

9. Отдел личного состава.

Помимо этого имелось шестнадцать «инспекций», заведующих как отдельными типами самолетов (например, Инспекции истребителей, бомбардировщиков и т.д.), так и практическим их применением (Инспекция по безопасности полетов). В мирное время инспекции входили в состав Министерства авиации.