Продолжая поддержку сербского народа, митрополит Кирилл встречался с руководством и сотрудниками различных структур ЕС и НАТО, донося до них глубокую озабоченность Русской Церкви положением сербского населения Косова, разрушением в крае православных храмов и святынь, растущей этнической разобщенностью на Балканах, поднимал эти проблемы на международных встречах и форумах, в переговорах с Генеральным секретарем ООН Пан Ги Муном и генеральным директором ЮНЕСКО Коитиро Мацуурой.
Защита прав, в том числе права на жизнь, палестинских христиан, безопасность паломников на Святой Земле были предметом постоянных церковно-дипломатических усилий митрополита Кирилла и ОВЦС. На встрече в 2008 году в Москве с главой Палестинской национальной администрации Махмудом Аббасом Русская Церковь еще раз подтвердила, что присутствие христиан на Святой Земле является фактором, укрепляющим дружбу между двумя странами, что Русская Церковь считает себя ответственной за судьбу христиан на всем Ближнем Востоке и всегда готова содействовать нахождению взаимопонимания между всеми противоборствующими сторонами. Участие митрополита Кирилла как полномочного представителя Русской Православной Церкви в миротворческом процессе принесло ему большой международный авторитет, который был еще раз подтвержден в 2006 году избранием его сопредседателем Всемирной конференции религий за мир.
В июне 2002 года Владыка во главе делегации Русской Православной Церкви посетил Брюссель, где встретился с руководством различных структур Европейского союза (председателем Европейской комиссии Романо Проди, членами Европейской комиссии и Европейского парламента). Митрополит Кирилл подтвердил готовность Русской Православной Церкви