Встреча Святейшего Патриарха Кирилла с главкомом Сухопутных войск В. В. Чиркиным и председателем Синодального отдела по взаимодействию с Вооруженными силами и право— охранительными учреждениями протоиереем Димитрием Смирновым. 2013 г.
В 2009 году по инициативе Патриарха главы традиционных религий России обратились к президенту РФ с предложением о воссоздании института военного духовенства. Предложение было поддержано, и началась многоплановая работа, в настоящее время осуществляемая Русской Православной Церковью во взаимодействии с Министерствами обороны и внутренних дел.
В начале 2014 года Патриарх предложил ввести штатные должности военных капелланов и в системе Министерства внутренних дел. На Архиерейском Соборе 2013 года Святейший поставил задачу распространить эту практику в странах канонической ответственности Русской Православной Церкви, где до сих пор служение духовенства в воинских подразделениях регулируется не законами, а двусторонними соглашениями между церковными и военными ведомствами.
По данным на конец 2020 года, численность духовенства в Вооруженных силах России на штатных должностях составляет 231 человек. На территориях воинских формирований или в непосредственной близости от них действуют 699 храмов, 177 часовен, 116 молитвенных комнат.
Активным и плодотворным является сотрудничество Русской Православной Церкви с казачеством, единство которого основано на верности Православию. На состоявшемся в октябре 2009 года в Новочеркасске заседании Совета при Президенте России по делам казачества Патриарх подчеркнул, что
Выездное заседание Совета при Президенте Российской Федерации по делам казачества. Новочеркасск. 2009 г.
Одной из первых задач Патриарх Кирилл определил