В результате разгрома противников в Сирии Омейяды сумели ампутировать конечность, но голова в Хиджазе все еще оставалась живой. Там «антихалифат» Ибн аз-Зубайра продолжал существовать до тех пор, пока сын и преемник Марвана Абдул-Малик не послал против него своего железного полководца аль-Хаджжаджа ибн Юсуфа, когда-то школьного учителя в Таифе. Аль-Хаджжадж принадлежал к тому же племени такиф, что и аль-Мугира. Тогда ему шел тридцать второй год. Его армия насчитывала 20 тысяч человек. В течение шести с половиной месяцев, начиная с 25 марта 692 года, аль-Хаджжадж вел осаду Мекки. Он колебался не более, чем Хусейн, перед тем, как действенно применить свои катапульты против Священного города. Вдохновляемый героическими наставлениями своей матери Асмы, дочери Абу Бакра и сестры Аиши, Ибн аз-Зубайр сражался отважно, но без надежды на успех. В конце концов его убили. Голову отправили в Дамаск, а туловище, подвешенное вверх ногами на кресте, доставили к его матери. Это первый раз, когда мы слышим о распятии в исламе.
Со смертью Ибн аз-Зубайра ушел последний поборник первозданного ислама. Усман был отомщен. Сила ансаров («помощников») была сломлена навсегда. В исламе надежно установилась новая ориентация; политическое в государственной власти получило почти полное господство над религиозным. Отныне Мекка и Медина отошли на второй план, и история Аравии начинает все больше затрагивать влияние внешнего мира на полуостров, нежели влияние полуострова на внешний мир. Изолированная родина исчерпала себя.
Абдул-Малик передал управление Хиджазом в руки аль-Хаджжаджа. На этом посту он продержался несколько лет, в течение которых усмирил не только этот регион, но и Йемен и Ямаму на Востоке. В 694 году на него была возложена столь же, если не более, сложная задача по управлению Ираком.
В Ираке по-прежнему кипело недовольство. Тамошние жители были «народом раскола и лицемерия». Помимо бывших сторонников аз-Зубайра и обычных шиитов, там оставались хариджиты и те из приверженцев Алидов, которые после смерти Хусейна провозгласили своим имамом и махди его сводного брата Мухаммеда ибн аль-Ханафию. Этот Мухаммед приходился сыном Али, а имя получил в честь матери. Особенно много неприятностей доставляли хариджиты. Из-за них на Востоке постоянно царила смута. Из Ирака они распространились на Персию, разделились на несколько фанатичных теократических сект, захватили Ахваз и Керман, заняли Рей, осадили Исфахан и оставляли за собой опустошение, где бы ни шли. В Персии они объединились с восстанием мавали («подопечных»), против арабских господ. Это были персы, которые приняли ислам, думая, что в нем все верующие равны, но их постигло разочарование и крушение иллюзий.