В 1939–1940 годах Н. К. Чуковский принимал участие в советско-финляндской войне, был корреспондентом газеты «Красный Балтийский флот».

С начала Великой Отечественной войны офицер Н. К. Чуковский работал в газете одного из соединений морской авиации на «ораниенбаумском пятачке», который находился в блокадном кольце осажденного Ленинграда. Свой военный путь он закончил в 1945 году, пройдя тяжелые дороги войны от Ленинграда до Берлина.

В произведениях военных лет писатель детально воспроизводит военные будни, но, несмотря на страдания и смерть, они проникнуты светлой верой в победу народа.

Беспримерному подвигу морских летчиков, защищавших небо Родины от фашистских стервятников, Н. К. Чуковский посвятил роман «Балтийское небо», вышедший в свет в 1955 году. Как участник боевой жизни авиационного полка, он рассказал о своих однополчанах, друзьях-летчиках, многие из которых ценой собственной жизни спасли от фашистов нашу страну. Яркие страницы книги посвящены мужеству и героизму, огромному нравственному подвигу ленинградцев, выдержавших 900-дневную блокаду. Они получали по 125 граммов хлеба в день, умирали от голода, но не сдались врагу. Девиз ленинградцев был: «Тот, кто не сдастся, тот не умрет!»

Роман «Балтийское небо» был переведен на многие языки мира. В 1961 году по роману был создан замечательный одноименный двухсерийный фильм. Его посмотрели миллионы, и он не утратил своего значения и в настоящее время, находя глубокий отклик в сердцах людей.

Военным морякам, сражавшимся в Великой Отечественной войне, Н. К. Чуковский посвятил несколько повестей: «Двое» (1942), «Девять братьев» (1943), «Кайт» (1943), «Ночи на острове» (1945), «Морской охотник» (1945; на основе этой повести в 1954 году был снят кинофильм для детей), а также «Остров Сухо» (1951).

В последние годы жизни писателя глубоко волновали морально-нравственные проблемы. Он создал ряд произведений, проникнутых лиризмом и психологической правдой: «Неравный брак» (1963), «Ранним утром» (1964), «Девочка Жизнь» (1965), «Цвела земляника» (1965).

Николай Корнеевич на протяжении всей жизни писал для детей и юношества, был писателем разносторонним, неутомимым, и его многочисленные книги посвящены таким же деятельным, целеустремленным людям.

В книге «Водители фрегатов» Н. К. Чуковский рассказал о необычайно смелых, упорных морских капитанах, которые были одержимы мечтой об открытии новых континентов. Писатель назвал их водителями фрегатов. В XVIII — начале XIX века фрегатом назывался трехмачтовый военный корабль, имевший на борту до 60 пушек. Это было деревянное маломощное судно, зачастую не выдерживавшее шторма. И вот такие корабли под парусами вели вперед мужественные капитаны. От их искусства управления судном полностью зависели выбранный маршрут в океане и жизнь моряков. На этих фрегатах были сделаны открытия, изменившие географическую карту мира и судьбы народов. Отважные и искусные моряки открывали неведомые континенты, моря и острова, заливы и проливы во всех концах земного шара.