В 1457 г., после смерти Тимурида Бабур-мирзы, правителя Хорасана, Абу-Саид завладел этой провинцией. 19 июля 1457 г. он вступил в Герат. Отныне владыка Хорасана и Трансоксианы, он принялся восстанавливать тимуридскую империю в той мере, в какой это позволяли постоянные соперничество и мятежи его родственников. Чтобы ослабить чагатаидского хана Моголистана Есенбугу II, он прибег к обычной системе. Ранее (1429) Есен-буга изгнал своего старшего брата Юнус-хана, который бежал в Самарканд, к Улугбеку. В 1456 г., желая создать соперника Есен-буге, тимуридский правитель признал Юнуса легитимным ханом. С войсками, предоставленными ему Абу-Саидом, Юнус вступил в Моголистан и добился признания себя ханом в западной части страны, в районе Или, тогда как Есен-буга остался правителем восточной части, с Юлдусом и Уйгуристаном. Чуть позже Юнус двинулся на Кашгар. Он был остановлен и разгромлен между этим городом и Аксу Есенбугой, примчавшимся из Юлдуса, и эмиром Саид Али из рода Дуглат, эмиром Кашгара. Юнус вновь бежал в Трансоксиану, к Абу-Саиду (ок. 1458). Тот снова дал ему подкрепления, с которыми тот, очевидно, снова занял западную часть Моголистана, в районе Или и Иссык-Куля. Тем временем Восточный Моголистан (Юлдус и Уйгурия до Турфана) по-прежнему принадлежал Есен-буге (ум. 1462), а потом его сыну Дуст Мухаммед-хану (1462–1469), который обычно пребывал в Аксу. Так что Абу-Саиду в полной мере удалось нейтрализовать возрождающиеся силы Чагатаидов, спровоцировав раздел их владений между двумя враждующими ветвями.

На персидском направлении Абу-Саид действовал не менее энергично. Как мы видели, западная часть этой страны, Азербайджан, Арабский Ирак, Персидский Ирак с Исфаханом, Фарсом и Кирманом подпали под власть Джахан-шаха, вождя туркоманской орды Черного Барана (Кара-Коюнлу). В 1458 г. Джахан-шах пошел походом на Хорасан и захватил Герат (июль 1458 г.), но шесть месяцев спустя Абу-Саид, удалившийся в Балх, нанес на берегах Маргуба его сыну Пир Будаку сокрушительное поражение в кровавой битве, освободившей Хорасан: город Семнан между Дамганом и Реем был признан границей между владениями Тимуридов и Черного Барана (приблизительно декабрь 1458 г.). В своих собственных владениях Джахан-шаху пришлось бороться с соперничающей туркоманской ордой Белого Барана (Ак-Коюнлу), обосновавшейся в Диярбекире и еще со времен Тамерлана бывшей традиционной союзницей Тимуридов. В 1467 г., желая покончить с этими соперниками, Джахан-шах выступил на Диябекир, но 11 ноября 1467 г. он был застигнут врасплох и разбит в Киги, между Мушем и Эрзинджаном, Узун Хасаном, вождем Белого Барана, а затем убит во время бегства. В результате этой катастрофы владения Черного Барана отошли к соперничавшей с ним орде.