За три дня до смерти Матрона сообщила близким точное время своей кончины и все эти три дня, будто торопясь сделать побольше доброго, неограниченно принимала посетителей. Она сама распорядилась отпеть ее в церкви Ризоположения на Донской улице, а похоронить на Даниловском кладбище.
Многие годы, вплоть до обретения мощей св. блаженной Матроны в 1998 году, за могилкой старицы ухаживала ее землячка Антонина Борисовна Малахова. Она так рассказывает об отпевании и погребении Матроны: «Гроб с ее телом стоял в середине церкви, лицо открыто. Ручки у нее были такие маленькие, пухленькие, как у младенца. И все подходили, прикладывались к рукам. Все, кто был в церкви, плакали: потеряли самое дорогое – путеводительницу в жизни, как жить без нее? Такая опора была – скажет слово, и не думаешь, не терзаешься, все так и будет… Я передать не могу, что в церкви я чувствовала: что-то необычное, будто по воздуху ходила… Ее отпели и четвертого мая похоронили на Даниловском кладбище. Снег шел, как сейчас помню». Упоминая об открытом лице новопреставленной, А. Б. Малахова подчеркивает, что Матрона не была монахиней. А вот сама Антонина Борисовна после обретения мощей свой подопечной, будто выполнив долг перед ней, приняла монашеский сан и ушла в монастырь, куда-то неподалеку от своего родного Себина.
По правде сказать, вплоть до 1990-х о могилке Матроны на Даниловском кладбище мало кто знал. Как блаженная и предсказывала. Конечно, ее навещали духовные чада покойной и их знакомые. Возможно, даже могила была самой посещаемой на кладбище. Но по сравнению с тем, какой поток к ней хлынул с начала девяностых, можно сказать, что до того Матронина могилка оставалась заповедной.
Массовое паломничество к Матроне на Даниловское кладбище породило целый литературный жанр – свидетельства чудесной помощи блаженной своим молитвенникам. Теперь уже о десятках святых собраны целые тома подобных свидетельств – об о. Валентине Амфитеатрове, о. Алексее Мечеве, старце Аристоклии, Ольге (Ложкиной) и других. Но своим рождением интереснейший жанр обязан прежде всего именно Матроне.
Свидетельств чудесной помощи Матроны собрано и издано несколько книг. Вспомним лишь некоторые из этих свидетельств. Они интересны не только как рассказы о Матронином заступничестве, но еще и как своеобразные памятники эпохи, улики истории.
Целых четыре года отец Александр, дьякон из Тверской области, без костылей шагу не мог ступить – нога отнялась и волочилась, будто неживая. В богослужениях болящий больше не мог участвовать, но лишь кое-как помогал пономарю в храме. Тогда он решился отправиться в Оптину пустынь, чтобы приложиться к мощам преподобного Амвросия Оптинского. Это был 1994 год. Как можно понять, о Матроне дьякон тогда еще не знал. Потому что наверняка ехал из Твери в Калугу через Москву, но на Даниловское кладбище тогда не зашел. И вот там, в Оптиной, ему и рассказали, что в Москве почивает одна старица, хотя и не канонизированная, но истинная чудотворица. Помолившись у мощей св. Амвросия, который, кстати сказать, при жизни славился дарованием исцелять болезни, и, видимо, не вымолив его помощи, скорбящий дьякон поехал назад в Москву. Он едва доковылял на костылях до Даниловского кладбища и там целый день молился у могилки Матроны. К вечеру ему так полегчало, он так взбодрился, что после целого дня молитвы возвращался, будто хорошо отдохнул. На следующий день ему стало еще лучше. А на третий день дьякон выходил с кладбища без костылей! Костыли исцеленный так и оставил у могилы, как свидетельство явленного Небесами чуда.