Получив степень магистра, Зибер скоро получил и кафедру, но недолго ее занимал. Киевский университет в то время постоянно был раздираем профессорскими столкновениями и интригами. В одну из таких историй, хотя лично совершенно непричастный этим дрязгам, но не видя в них ни удовольствия, ни призвания, Зибер вышел в отставку и посвятил себя исключительно литературным занятиям. К этому времени относится ряд его статей в «Знании» о теории Карла Маркса, в то время мало известной в России. Затем началась его знаменитая в свое время полемика в защиту основных принципов классической экономии, полемика с г. Чичериным в одну сторону, г. Юлием Жуковским – в другую. Замечательная ясность мысли, сила доводов и громадная эрудиция дали ему полное торжество над его учеными оппонентами. После того как прекратилось «Знание», Зибер одно время сотрудничал в «Слове», где напечатал ряд весьма интересных очерков современного экономического состояния Западной Европы и, между прочим, замечательный теоретический этюд об отношениях между правом и экономией. Далее, после того как в 1879 г. прекратилось и «Слово», Зибер сотрудничал почти во всех прогрессивных журналах того времени, в «Отечеств. записках», «Деле», «Русской мысли», «Юридическом вестнике» и др. Статьи были и практические, касающиеся современной экономической злобы дня Западной Европы, и теоретические, заключавшиеся большей частью в анализе новых экономических учений и трактатов. Из статей первого рода выдается посвященная ирландскому аграрному движению и напечатанная в «Юридическом вестнике».
Как ни ценны сами по себе эти журнальные работы покойного экономиста, серьезный памятник в русской учебной литературе он себе воздвиг не ими, а обширным трактатом «Первобытная экономическая культура», изданным г. Солдатенковым в Москве в 1883 году. Сочинение Зибера в своем роде единственное не только в русской, но и во всемирной литературе и явилось плодом многолетних неутомимых трудов сведущего и талантливого исследователя. К сожалению, трактат этот можно считать последним словом Зибера. Некоторые статьи его, появившиеся после того, поразили неясностью и сбивчивостью изложения, качествами, которыми менее всего отличался Н. И. Недоумение, возбужденное этим, к сожалению, скоро разъяснилось самым неприятным образом. Пришло известие, что его привезли к родным в Ялту в состоянии психического расстройства. Не хотелось верить, что могла пошатнуться эта могучая интеллектуальная сила и что становится мертвым и бесполезным весь этот громадный капитал знания, образования и таланта, который скопился в голове этого вечного умственного труженика, жившего, казалось, исключительно умственною жизнью, ее интересами и задачами. Вскоре, однако, пришлось убедиться в печальной истине, что Н. И. Зибер, безвозвратно потерянный для литературы, скоро будет потерян и для жизни. Жестокий недуг его был признан лучшими психиатрами неизлечимым. Обнаружилась болезнь его летом 1884 года, когда ему было всего тридцать восемь лет; скончался же он сорока двух лет, в мае текущего года.