Работа по всем следственным делам за отчетный период проведена без нарушений уголовно-процессуальных норм. Однако в ряде опергрупп в виду недостаточной квалификации следственных работников и отсутствия достаточного контроля со стороны начальников этих групп, имели место и серьезные недочеты в следствии по делам, сводившиеся, главным образом, к тому, что следствие проводилось поверхностно, не вскрывалось всей преступной деятельности арестованных, и в ряде случаев, неисследованные дела направлялись по подсудности. Эти недочеты своевременно устранялись.
Руководство следственной работой в подчиненных органах «Смерш» и опергруппах осуществлялось путем командирования на места для проверки и оказания помощи в следствии опытных работников управления «Смерш», а также путем вызова следственных работников с докладами по делам в 4-й отдел и дачи по ряду дел письменных указаний. В целях устранения имеющихся недочетов и повышения качества следственной работы был усилен контроль подчиненных органов «Смерш» и оперативных групп. Наиболее важные дела велись в управлении «Смерш» фронта[483].
Так, 29 августа 1945 г. в освобожденном частями Красной армии от японских оккупантов г. Хайларе на территории специальной тюрьмы особого отдела губернской полиции и Японской военной миссии местными жителями были обнаружены две ямы с закопанными трупами. Созданной местным самоуправлением комиссией с участием сотрудника отдела «Смерш» 36-й армии лейтенанта Гончаренко из ям было извлечено 43 трупа с отрубленными головами. При осмотре установлено, что все убитые за исключением одного монгола являлись русскими и евреями. Произведенным расследованием установлено, что в день начала войны Японии и СССР, по приказу начальника ЯВМ Ямано по заранее составленному плану (спискам) на советских граждан на случай войны с СССР сотрудниками этой миссии чиновниками Особого отдела городской полиции и жандармерии были произведены аресты советских граждан, проживавших в Хайларе. В этот же день на территории секретной тюрьмы японцы зверски умертвили перед бегством из города[484].
Согласно полученным указаниям значительные меры органы контрразведки «Смерш» фронтов, их оперативно-разыскные группы предпринимали по розыску, задержанию и интернированию императора Маньчжоу-Го Пу И, членов его семьи, высокопоставленных чиновников правительственных учреждений этого марионеточного государства.
Так, 30 августа и 7 сентября 1945 г. УКР «Смерш» Забайкальского фронта произвел задержание и доставку членов правительства Маньчжоу-Го, которые были переданы Управлению НКВД по Читинской области для содержания в лагере для интернированных в поселке Молоковка Читинской области[485].