Взволнованный римский истеблишмент немедленно предпринял ответные шаги, по крайней мере, так полагали левые. В сентябре 1981 года проводившим обыск на фабрике Джелли прокурорам в Милане было приказано передать документы судьям в Риме, где местная прокуратура славилась тем, что замедляла и усложняла рассмотрение сложных политических дел.
Разоблачение «П2» лишило защиты и члена ложи Роберто Кальви. Его банк Banco Ambrosiano обанкротился на следующий год, а в июне 1982 года Кальви нашли повешенным под мостом Блэкфрайерс в Лондоне. По сей день никто точно не знает, был ли он убит или покончил жизнь самоубийством. В 1984 году жертва подставного похищения Микеле Сидона был наконец-то экстрадирован в Италию, где его судили и отправили в тюрьму за финансовые преступления. В марте 1986 года его также признали виновным в заказном убийстве ликвидатора имущества его банка. Сидона умер в тюрьме через два дня после того, как выпил эспрессо с цианидом. И хотя это выглядело как самоубийство, активно ходили слухи о том, что его заставили замолчать.
В офисах Джелли в уругвайской столице Монтевидео были проведены обыски, в ходе которых обнаружились, помимо прочего, строго засекреченные бумаги, принадлежащие итальянским секретным службам. Лишь небольшая часть этой уругвайской находки попадет обратно в руки властей полуострова. Однако оставались подозрения и остаются до сих пор, что список членов «П2», найденный в офисе Джелли в Ареццо, был неполон и что еще сотни других высокопоставленных лиц были связаны с ложей.
В деле «П2», которое так и не было закончено, очень много неясностей. Как сказала глава парламентской комиссии по расследованию деятельности ложи Тина Ансельми: «История “П2” уникальна. Она полна неоднозначности и фактов с двойным значением. Вместе с доказательствами, подтверждающими одну теорию, <…> почти всегда всплывают обстоятельства, говорящие в пользу противоположной теории». Как будто в доказательство ее слов, участники расследования не могли прийти к согласию: когда в 1984 году они представили свои выводы, было подготовлено несколько документов: доклад большинства и не менее пяти особых мнений.