4 пехотные бригады, сформированные в 1991 году, были преобразованы в Гвардейские моторизированные бригады в декабре 1992 года. Их число было увеличено до 7. 23 декабря 1992 правительство Хорватии расформировало 19 отдельных пехотных батальонов и сформировало из их бойцов 5 отдельных гвардейских батальонов (номера 80–84).

Защита любой из шести Оперативных зон Хорватии в 1992–1995 году должна была обеспечиваться силами: 0–2 Гвардейских моторизированных бригад, 2-15 моторизированными бригадами или полками Домобранства, 0–3 отдельными гвардейскими батальонами вместе со штабным подразделением (0–3 артиллерийских батальона, 0–2 противотанковых батальона, 0–1 бригада ПВО, 0–1 инженерная бригада или батальон, а также разведывательная рота и батальон военной полиции). Реальный состав защитных частей зависел от текущего положения на линии фронта, а также от числа имеющихся у Хорватов резервов. В феврале 1993 года система Оперативных зон была упразднена и ей на смену пришла система Корпусных округов.

Во время конфликта с Сербами хорватская армия вела, в основном, позиционную войну. Фокальными точками противостояния становились хорватские города, осажденные Сербской армией, или сербские города, осажденные хорватскими подразделениями. Регионом наиболее интенсивных боев стала Славония, на территории которой сражались многочисленные хорватские подразделения, усиленные полицейскими частями, батальонами специального назначения и бойцами ХСП (Хорватская партия справа — прямые наследники усташей).

На ранних этапах войны хорватские специальные подразделения несли большие потери. Их бойцы, не имели единой подготовки и частенько, вступали в бой не имея четкого плана действий. Особенно тяжелыми потери были на вражеской территории. Не сумев преодолеть «линию фронта», хорваты попадали в «мешок» и уничтожались наступающими силами сербов при помощи танков или тяжелой техники.

Большую эффективность хорватские специальные подразделения продемонстрировали во время действий на своей территории. Эффективными были и их атаки вражеских механизированных колонн (применялась тактика уничтожения первой и последней машины с последующим уничтожением центра колонны). На первом этапе войны подобные нападения происходили так часто, что у Сербских танкистов этот период получил название Кукурузная война (хорваты любили использовать для засад заросли цветущей кукурузы).

Понимая слабость собственного спецназа, хорваты всерьез взялись за обучение бойцов силами западных военных специалистов. К концу войны специальные силы хорватской армии могли проводить успешные боевые рейды в глубоком тылу противника.