Реорганизация не затрагивала ИРУ КГВ, в непосредственном подчинении которого оставалась только абаганская ЯВМ, осуществлявшая разведывательно-подрывные акции против Монгольской Народной Республики.
Эта структура в Маньчжурии просуществовала до конца июля 1945 г., когда была предпринята новая попытка его усовершенствования.
В это время спецслужбы Японии в борьбе против Советского Союза перешли на оборонительные позиции. Они возвратились к тактике использования массовой агентуры. Стремились реорганизовать свои разведывательные органы, для того чтобы эффективнее использовать их в возможной оборонительной войне против СССР.
Последние предвоенные реорганизационные мероприятия сводились к созданию на территории Маньчжурии т. н. особых отрядов охраны. Предполагалось, что они будут являть собой мобильные военизированные подразделения японских спецслужб с наделением их функциями бывших ЯВМ, жандармерии и особых отделов управления полиции.
Реорганизацией предусматривалось переподчинение всех периферийных ЯВМ командирам вновь создававшихся отрядов охраны с окончательным выходом из подчинения ИРУ. Однако в связи с началом и скоротечностью боевых действий она не была осуществлена до конца, что отрицательно сказалось на эффективности реализации разведывательно-подрывных акций противника в ходе боевых операций на Дальнем Востоке.
9 августа 1945 г. Советский Союз, верный своим обязательствам по антигитлеровской коалиции, объявил Японии войну. Подчеркнем, что для японского правительства это было неожиданным, т. к. разведывательные органы ориентировали, что советские Вооруженные силы смогут выступить против Японии только к концу зимы – началу весны 1946 г. В результате стремительного наступления Красной армии японские спецслужбы не смогли осуществлять управление разведывательно-подрывной деятельностью, применить преступные средства ведения бактериологической войны.
Особо хочется отметить большую эффективность деятельности контрразведывательного аппарата советских органов госбезопасности в годы войны с Японией. В ходе наступления частей Красной армии на территорию Маньчжурии пограничными войсками НКГБ СССР были разгромлены японские гарнизоны, дислоцировавшиеся на приграничной с СССР территории.
Командование Советской армии своевременно получало объективную информацию о дислокации, численном составе, вооружении, передвижении частей и соединений Квантунской группировки войск и японской Корейской армии, что способствовало быстрому разгрому японских войск.
В это время органам военной контрразведки «Смерш» удалось полностью разгромить специальные службы Японии, которые в течение почти 30-летнего временного периода занимались организацией и осуществлением подрывной деятельности против СССР.