Несмотря на определенную дезорганизацию в начале войны, чекисты смогли оперативно перестроить свою работу в соответствии со складывающейся оперативной обстановкой. Определенные недостатки при организации работы в тылу противника, отсутствие скоординированного взаимодействия руководства Наркомата госбезопасности республики с командованием советских воинских частей, действовавших на территории Белоруссии, а также между отдельными территориальными подразделениями НКГБ БССР, дефицит квалифицированных кадров, уничтоженных в ходе репрессий, трудности с материально-техническим обеспечением и другие сложности первого периода войны, не позволили отдельным чекистским подразделениям выполнить поставленные задачи, однако, в целом, НКГБ – НКВД удалось внести весомый вклад в организацию и развитие партизанского движения на оккупированной территории Белоруссии.
Набираясь опыта, чекисты не только успешно осуществляли боевые, диверсионные и иные операции, но и достойно противостояли спецслужбам Германии, обеспечивая руководство страны ценной разведывательной информацией и ограждая партизанские формирования от агентуры противника. При этом деятельность ОГБ по развитию партизанского движения заключалась не только в увеличении количества созданных партизанских формирований, а, в первую очередь, в улучшении их боеспособности за счет качественно организованной разведывательной, контрразведывательной работы, обучения партизан тактике борьбы с врагом, минно-подрывному делу, основам конспирации, маскировки и т. д.
В ходе противоборства с противником формировались новые и усовершенствовались существующие формы и методы работы, учитываемые при ее правовом регулировании. Можно констатировать, что деятельность НКГБ – НКВД была организована на довольно высоком уровне, приносила весомые результаты и стала одним из факторов победы в войне.
Основная работа по формированию диверсионно-разведывательных групп и партизанских отрядов была проделана в 1941 г., в дальнейшем она была продолжена, что позволило усилить боеспособность партизанских отрядов, расширить зоны их действия и вовлечь в них широкие массы населения, и, в целом, повысить эффективность борьбы с оккупантами. Профессиональные знания и умения чекистов, касающиеся организации и ведения партизанской борьбы, разведывательной и контрразведывательной работы, повышали боеспособность партизанских формирований. История войны убедительно продемонстрировала, что значительный вклад в разгром оккупантов внесли партизанские формирования, возглавляемые чекистами, прошедшими в свое время специальную подготовку и имевшими опыт ведения партизанской войны в Западной Беларуси в 1920-е гг. и в ходе гражданской войны в Испании.