Сразу после своего назначения Блобель приступил к организации уничтожения останков жертв в Аушвице, а также Бельжеце, Собиборе. К ноябрю 1942 г. было эксгумировано 107 тыс. тел в Аушвице, к марту 1943 г. 500 тыс. тел в Собиборе и Бельжеце. Здесь разрабатывались и апробировались технологии уничтожения большого объема эксгумированных останков, а также специальное оборудование, предназначенное для этих целей (сборные печи, костедробилки и др.).

Параллельно с проведением операции в Польше осенью 1942 г. Блобель посетил Киев, считая необходимым начать эксгумацию в этом районе. Эта поездка была неслучайной, так как Блобель в качестве руководителя зондеркоманды 4а принимал участие в убийствах на Украине, в том числе и в Бабьем Яру, поэтому был как никто осведомлен о масштабах совершенных преступлений. Однако после совещания с главой ЗиПо/СД Томасом было принято решение отложить эту операцию в силу сложных погодных условий. Весной 1943 г. Пауль Блобель вновь посетил оккупированную территорию Советского Союза. На этот раз он приехал во Львов, где обсудил детали секретной операции с командующим СС и полиции Галиции Фрицем Катцманом. В результате Яновский концентрационный лагерь стал первым местом на территории СССР, где начала осуществляться «акция 1005» (Spector, 1990: 162).

15 июня 1943 г. в Яновском лагере было отобрано 75 еврейских заключенных. Они были размещены в отдельном бункере за пределами лагеря. Вскоре их количество увеличили до 129. Узники должны были работать под охраной 8–10 эсэсовцев и 70 человек полицейских-шупо. Заключенные уничтожали доказательства нацистских преступлений в двух местах массовых расстрелов – Песках, неподалеку от концлагеря, а также в лесу поблизости от Лычаковской улицы. Узники разбивались на группы, число которых доходило до девяти. Они вскрывали могилы, извлекали из них трупы, укладывали тела на заготовленные дрова, обливали бензином и поджигали. Останки перемалывались в специальной машине, которая была обнаружена на территории лагеря после его освобождения. Пепел просеивали, чтобы выявить золотые коронки, обручальные кольца и иные ценные вещи. За один день уничтожалось до 2 тыс. трупов. Только в Песках членами зондеркоманды было уничтожено не менее 40–50 тыс. трупов. Всего же в районе Яновского концлагеря и Лисиничского леса, по данным членов зондеркоманды, было уничтожено около 200 тыс. человек (Аристов, 2018: 310).

Опыт организации «акции 1005» в Яновском лагере в дальнейшем использовался в других оккупированных районах Советского Союза. В самом концентрационном лагере были организованы курсы для эсэсовцев по подготовке и проведению кремаций. Руководил ими унтерштурмфюрер СС Шэллок, координировавший ранее процесс уничтожения трупов в Яновском лагере. Эти курсы включали: