Многие предметы мебели сохранились в музее, но кое-что заменили герцоги Лотарингские и король Виктор Эммануил II Савойский. На первом этаже дворца Питти, в Музее серебра, собрана коллекция всех драгоценностей Медичи: камеи, слоновая кость, горный хрусталь, серебро, жемчуг, золотые украшения, китайский и японский фарфор, миниатюрные портреты, античные и современные вазы из поделочных камней, изделия из янтаря, серебряная с позолотой посуда, реликварии, лиможская эмаль и многое другое. Фердинанд II пополнил огромную коллекцию предков, он покупал картины, древности, полудрагоценные камни, часы, античные вазы, кубки, амфоры, камеи, ювелирные изделия, статуи. Он собрал столько произведений искусства, что, говорят, из предметов одной только его коллекции можно было создать целый музей. Братья Медичи как будто соревновались друг с другом: кто больше соберет. Они также разыскивали и выкупали произведения искусства, которые пропали из коллекции Медичи после второго изгнания, и те, что отсудила Маргарита Австрийская, вдова Алессандро Медичи.

В саду Боболи тоже шли работы: в самой верхней части была сделана терраса с клумбами, в которых высаживали несравненной красоты розы Банкса, Бурбон и чайные, а также пионы и георгины. В центре террасы установили фонтан Обезьян – он украшен тремя обезьянками работы скульпторов Джамболонья и Пьерино да Винчи. Кардинал Леопольд заказал там построить для него небольшое одноэтажное здание с тремя комнатами, где он принимал друзей и ученых. Сейчас в этом помещении расположен Музей фарфора, где собраны изделия из фарфора производства европейских фабрик из коллекции Медичи, герцогов Лотарингских и сестры Наполеона Элизы Бачокки. С этой террасы открывается великолепный вид на окрестные холмы с замками, виноградниками, оливковыми рощами и кипарисовыми аллеями – типичные тосканские пейзажи.

В восточной части сада была построена теплица для цитрусовых, где в 1644 году Фердинанд экспериментировал с чем-то вроде искусственного инкубатора для рождения цыплят на основе температуры, измеренной 60 градусным термометром, помещенным под наседку. Рядом был Нижний сад, где выращивали лилии и другие водные растения. С другой стороны от Нижнего сада был построен небольшой зоопарк с экзотическими животными, самым интересным из которых в те времена был бегемот. Бедный гиппопотам прожил недолго в тосканском климате, после смерти его забальзамировали, его чучело находится в музее натуральной истории Спекола. Впоследствии зоопарк ликвидировали герцоги Лотарингские и построили на его месте большое здание для выращивания цитрусовых под названием Лимонайа. При них же в старой части сада была построена венская кофейня, где подавали модные напитки: кофе и горячий шоколад.