Не имея возможности напрямую присоединить Сиам и Ланну к Бирме, Байиннаун оставил в этих странах бирманские гарнизоны, посадил на их престолы своих ставленников, а детей последних забрал в качестве заложников.

Зависимость Сиама от Бирмы продолжалась недолго. Завоевания Байиннауна, в результате которых бо́льшая часть Индокитая (кроме Вьетнама и Камбоджи), а также юго-западная часть нынешней китайской провинции Юньнань вошли в состав самого крупного в истории региона государства, оказались кратковременными. Созданная бирманским королём империя была слабо связана экономически и базировалась исключительно на талантах одной личности и мощи бирманской армии. В стране были талантливые военные, выдвинувшиеся в череде ожесточённых войн как внутри Бирмы, так и с её соседями, но не было гражданских управленцев, способных сберечь завоёванное. При незадачливом преемнике Байиннауна Нандабайине (1581–1605) всё рухнуло. В результате освободительных войн 1584–1593 гг. Сиам под руководством принца Наресуана, показавшего себя незаурядным полководцем, вернул свою независимость. К началу XVII в. территория Сиама даже существенно расширилась за счёт ряда бирманских территорий – Пегу и Тенассерима. Кроме того, на короткий период вассалами Сиама стали лаосское королевство Ланна и Камбоджа.

В следующий раз Сиам едва не лишился независимости в 1764–1767 гг., когда бирманцы под предводительством короля-воина Схинбьюшина (1763–1776) снова вторглись в страну. Бирманцам удалось взять штурмом и разрушить столицу Сиама г. Аюттхая. Трудно сказать, как бы могло сложиться далее, если бы сама Бирма не подверглась маньчжуро-китайскому вторжению, что заставило бирманцев вывести бо́льшую часть войск из Сиама. На территории последнего наступил кратковременный хаос, преодолённый талантливым военачальником и новым королём страны Пья Таксином, которому удалось нанести поражение бирманцам и изгнать их из страны.

Бирманские вторжения в Сиам и Ланну не прошли для тайцев даром. Так, ещё в 1569 г., после первого завоевания, в Сиаме было введено бирманское летосчисление от 638 г. н. э., применявшееся до середины XIX в., а при дворе был введён ряд бирманских обычаев. Национальный герой Сиама принц Наресуан, воспитывавшийся заложником при бирманском королевском дворе, по преданию, перенёс немало техники из бирманского бокса летхвэй в тайский бокс муай-тай. Второе бирманское завоевание привело к переносу столицы Сиама из разрушенной Аюттхаи сначала в Тхонбури, а затем и в Бангкок.

На территории бывшего королевства Ланна, где бирманская зависимость продолжалась намного дольше, долгое время для записи местного наречия тайского языка активно использовался бирманский алфавит, а в некоторых городах, например, в г. Лампхун, до сих пор можно видеть храмы, построенные в смешанном лаосско-бирманском стиле.