В 1788 г. взятие укрепленного острова Березани.
Трофеями этой победы были: 13 турецких знамен, 21 пушка и большое количество военных боевых и продовольственных припасов, заготовленных для Очакова.
Этот последний геройский подвиг Головатого, доведенный до сведения государыни всеподданнейшим донесением князя Потемкина, имел большое значение для успешной осады Очакова, чем и ускорилось взятие самой крепости штурмом 6 декабря.
Кроме личной благодарности главнокомандующего, полковник Головатый был награжден за взятие Березани Георгиевским крестом.
В 1790 г. он участвовал при взятии Измаила. В штурме крепости Измаила в ночь на 11 декабря участвовало до 4000 казаков Черноморского казачьего войска, находившиеся все на судах Дунайской флотилии. Во время штурма в первой линии стал Головатый и первый принял на себя выстрелы из Измаильской крепости. Здесь, под тучей неприятельских ядер и картечи, он высадил на берег в полном порядке десант, состоящий из 2000 черноморских казаков и части регулярных войск. Немедля Головатый послал 600 своих казаков с топорами и лопатами рубить крепостные палисады; эти передовые храбрецы, предводимые самим Головатым и вовремя подкрепленные подоспевшими товарищами, захватили турецкие батареи и некоторые городские укрепления до Киликийских ворот, после чего, оборотя турецкие пушки во взятых ими батареях, направили свой артиллерийский огонь на город.
Этот геройский подвиг предводителя Черноморских казачьих полков настолько был блистателен, что сам главнокомандующий князь Потемкин во всеподданнейшем донесении своем государыне писал: «Полковник Головатый с беспредельной храбростью и неусыпностью не только побеждал, но и, лично действуя, вышел на берег, вступил с неприятелем в бой и разбил оного».
За это дело Головатый был награжден орденом Св. Владимира и, кроме того, получил Измаильский крест.
После турецкой войны Черноморскому казачьему войску предстояло переселение на назначенный ему остров Тамань; но так как пространство этого острова весьма небольшое, а население этого войска было велико, то на раде войска было решено просить царицу дать оному для поселения еще и всю Кубанскую землю.
С этой просьбой был послан депутатом Головатый – герой войска черноморских казаков, лично известный при дворе ее величества.
Этот воин-дипломат так искусно повел дело, что по его ходатайству императрица Екатерина II, грамотой 30 июня 1792 г., не только пожаловала черноморцам Кубанскую землю с Таманским островом, но еще наградила это войско большим знаменем и прочими клейнодами, а Головатому пожаловала на дорогу большую фарфоровую кружку с барельефным медальоном портрета ее величества, насыпанную червонцами.