В 885 г., после нескольких лет непрерывных войн, Святополк заключил с королём Арнульфом мир и получил от него, в благодарность за помощь, оказанную Арнульфу в захвате престола, под свою власть Чехию, а также бывшее княжество Прибины Паннонию, находившуюся после смерти Коцела во власти немцев. Кроме того, в состав Великоморавского княжества при Святополке вошли, частью в порядке добровольного присоединения, частью — в порядке насильственного подчинения, группа славянских племён по Эльбе и Одеру, по Лужице (лужицкие сербы), силезские славяне, северновенгерские словаки и часть галицких славян в Карпатах. Однако после смерти Святополка моравского, при его сыновьях Моймире II и Святополке II, часть этих племён, воспользовавшись борьбою братьев за престолонаследие, отложилась от Великоморавского княжества. Внутренние распри между Моймиром и Святополком повлекли за собою вторжения на моравскую территорию немцев, предававших её беспощадному разорению и значительно ослабивших её мощь и подорвавших в глазах славянских племён её политический авторитет как державы, обеспечивавшей входившим в её состав племенам безопасность от немецких вторжений.

Отложившийся от Великоморавского княжества чешский союз племён, во главе со своими князьями Спитигневом и Вратиславом, признал немецкий протекторат над Чехией, что спасло этот западный участок Великоморавского княжества от разгрома его уграми (венграми), постигшего в 906 г. Моравию. Вместе с вторжением на территорию Великоморавии и разгромом её уграми Великоморавское государство прекратило своё существование, словацкий народ оказался отрезанным от чешско-моравских племён и в течение последующей тысячи лет своего существования находился под венгерским гнетом. Уцелевшая же от нашествия угров (венгров) или мадьяр западная часть Великоморавского государства, Чехия или Богемия стала естественным политическим центром чешско-моравских племён, и вскоре на смену Великоморавского княжества здесь выросло новое государственное объединение — Богемия, или Богемское княжество.

Между тем ожесточённая борьба Вихинга со славянским языком продолжалась вплоть до 892 г., когда мирные отношения между Святополком и Арнульфом были нарушены и между ними началась новая, длительная борьба. В 893 г. Вихинг отказался от своей епископской деятельности в Моравии и перешёл на службу к Арнульфу в качестве его советника. С уходом Вихинга моравская церковь осталась без главы.

Спустя несколько лет после этого старший сын и преемник Свя-тополка Моймир II предпринял ещё одну попытку воссоздать независимую церковную организацию в Моравии. Римская курия охотно пошла ему навстречу, и немедленно в Моравии было организовано церковное управление, подчинённое непосредственно Риму. Против этой инициативы римской курии в 900 г. ополчился баварский епископат, всегда считавший Моравию подведомственной в церковном отношении своей юрисдикции. В специальной жалобе он резко опротестовал мероприятия папы и выступил с не менее резкой националистической травлей славянского народа, не желая упускать из своих рук доходной статьи, какую представляла для немецких епископов Моравия. Однако ещё в X и XI столетиях славянское богослужение кое-где поддерживалось в Моравии, о чём говорят два дошедшие до нас знаменитые древнейшие памятника моравского происхождения, написанные глаголицей, так называемые «Киевские листки» и «Пражские отрывки». О том же свидетельствуют и славянские легенды о св. Вацлаве и св. Людмиле. Последняя, жена богемского князя Боривоя, обращённого вместе с нею в 874 г. в христианство Мефодием в Велеграде, умерла в 921 г. Она хорошо знала славянскую грамоту и посвятила в неё своего внука Вацлава, который умер в 935 г.