Ещё более упорную борьбу Пшемысловичей с племенными воеводами и лехами пришлось вести сыну и преемнику Болеслава II, Болеславу III, прозванному Рыжим. Восстание племенных владык и лехов против чешского князя, под главенством лехского рода Вршовичей, приняло настолько широкий, ожесточённый и угрожающий характер, что Болеславу III пришлось бежать за границу, в Германию. В Чехии с этого времени наступили тяжёлые внутренние неурядицы. Болеслав III жестоко расправлялся с племенными владыками и лехами, предавал их массовому уничтожению, на что последние отвечали Пшемысловичам новыми и новыми восстаниями под руководством Вршовичей, и тем не менее Пшемысловичи, поддержанные Германией, не выпустили из своих рук княжеского престола. Внутренними неурядицами, наступившими в Чехии со времени Болеслава III, пытался воспользоваться польский князь Болеслав Храбрый. После бегства за границу Болеслава III, поддерживая Вршовичей, он посадил на княжеский престол в Праге своего брата Владибоя, а после его смерти в 1003 г. продолжал поддерживать Вршовичей в их борьбе с Пшемысловичами, братьями Болеслава III — Яромиром и Ольдржихом (Ульрихом, 1012–1034), и захватил в свои руки земли, включённые в своё время Болеславом I в состав Чешского княжества, т. е. Моравию и Силезию. Однако сыну Ольдржиха Бжетиславу (Брячислав) удалось навсегда воссоединить Моравию с Чехией. Бжетислав (1035–1055) окончательно ликвидировал последние остатки родового строя в Чехии, превратив родовых владык и лехов в служилую аристократию, непосредственно подчинённую князю, вместе с чем в Чехии ликвидировались и последние остатки народовластия. Хотя областные веча ещё и продолжали собираться, но они уже не избирали князя, и круг их ведения был ограничен местными делами, решающая же роль на них принадлежала знати, княжеским чиновникам. Такой же характер получил теперь и общеземский сейм. Племенные разграничения вместе с воеводами исчезли, и постепенно стали забываться и самые имена племён. Чешское (Богемское) княжество окончательно сложилось и окрепло в аристократическую монархию с неограниченною княжеской властью, сосредоточенной в руках Пшемысловичей, обладавших к этому времени огромными богатствами, народные же массы оказались лишёнными каких бы то ни было политических прав.

Укрепив свои позиции внутри страны, Пшемысловичи, однако, не чувствовали себя обеспеченными в смысле политической независимости со стороны своего мощного соседа Германии. По-видимому, именно поэтому Бжетислав мечтает о создании, в противовес Германии, не менее мощного славянского государства и в осуществление своих планов завоёвывает Польшу, но в дальнейшем развитии этих планов встречает решительное сопротивление со стороны объединённых сил римского папы и германского императора Генриха III. Последний предпринимает в 1040 г. поход против Чехии, закончившийся поражением немецкой армии при Домажлице в западной Чехии, недалеко от Баварской границы, но в следующем же году возобновляет свои военные действия против Бжетислава и вынуждает его признать зависимость Чешского княжества от Германии. Таким образом, Бжетиславу, достигшему огромных успехов в деле внутренней стабилизации чешской государственности, не удалось тем не менее обеспечить Чехии независимость в международных отношениях. Внутренняя же стабилизация чешской государственности дала основания Бжетиславу провести реорганизацию системы престолонаследия, которая была рассчитана, прежде всего, на упорядочение внутридинастических отношений в роде Пшемысловичей, но фактически уже в самом начале XII в. дала совершенно обратные результаты. В силу этой реорганизации системы престолонаследия пражский княжеский стол закреплялся в порядке наследования за старшим в роде Пшемысловичей и превращался в великокняжеский стол, возглавлявший всё Чешское княжество; младшие представители того же правящего рода получали в своё ведение уделы. Таким образом, начиная с Бжетислава, Чешское княжество вырастает в удельное великое княжество. В международных же отношениях, в силу своей зависимости от Германской империи, оно известно как Богемское герцогство.