В русской армии произошли весьма существенные изменения. От прежней системы полков (большой полк, полки правой и левой руки, сторожевой и «прибылый» полки) завершился переход к системе «разрядов» – военно-территориальных округов. В них формировались воеводские или генеральские полки (которые можно сравнить с позднейшими дивизиями), в свою очередь включавшими в себя рейтарские, драгунские, солдатские и стрелецкие полки во главе с полковниками и стрелецкими головами (позднее – тоже полковниками). Эти полки и формировали действующую армию. Например, армия князя Черкасского в 1679 г. состояла из большого полка в составе 3 воеводских полков, из 4 «разрядов» (Новгородского, Казанского, Рязанского и Белгородского) по 2 воеводских полка в каждом и из отдельных отрядов.

Прежняя сотенная система решительно заменялась на новую, полковую и ротную, с соответствующими чинами командиров. В 1680 г. был издан указ, по которому ведено «быть из голов в полковники, из полуголов в полуполковники, из сотников в капитаны», и служить «против иноземного чину, как служат у гусарских и у рейтарских, и у пеших полков тех же чинов, которыми чинами пожалованы ныне, и впредь прежними чинами не именоваться». Стрельцы, городовые казаки и «дети боярские» «расписывались» по полкам. Общее количество дворян и «детей боярских» в сотенной службе сократилось в 2,5 раза, их в массовом масштабе записывали в рейтары. Стрельцы (за исключением московских) стали использоваться в основном для гарнизонной службы, в боевых действиях они почти не участвовали.

Изменилось и центральное управление. Все «ратные люди» переходили в ведение трех военных приказов: Разрядного, Рейтарского и Иноземного. Правда, еще сохранялись Стрелецкий, Пушкарский, Оружейный и Казачий приказы, но прежнего значения они не имели.

Улучшилось и вооружение армии. Тяжелые фитильные пищали заменялись более удобными и дальнобойными мушкетами (в пехоте) и карабинами (в коннице), вместо фитильного вводился ударно-кремневый замок. Усилили артиллерию. По данным Разрядного приказа, в крепостях насчитывалось более 3500 пушек. Полевую армию обычно сопровождали в походах 300–350 орудий, причем артиллерию имел каждый полк. Появились «винтовальные» (нарезные) и «органные» (многозарядные) орудия, «пушечные гранаты». В «разрядах» требовали, чтобы у «ратных людей» было единообразное и хорошее оружие, чтобы «у гусар было по гусарскому древку да по паре ж пистолей, а у рейтаров по карабину да по паре ж пистолей, у всех свои добрые и к бою надежные кони, у стрельцов, солдат и у иных чинов пехотного строя людей мушкеты и бердыши были добрые». Полки имели единообразное обмундирование, различавшееся цветом воротников, шапок и сапог, свои знамена.